RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299575.4

ATMIN-201, Transcript of ATM interactor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATMIN, Length 4,884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMIN-201ENST00000299575 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.63■■■□□ 2.17
ATMIN-201ENST00000299575 FGD1P98174 961 aa28.63■■■□□ 2.17
ATMIN-201ENST00000299575 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa28.62■■■□□ 2.17
ATMIN-201ENST00000299575 OSCARQ8IYS5 282 aa28.61■■■□□ 2.17
ATMIN-201ENST00000299575 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
ATMIN-201ENST00000299575 PRDM2Q13029 1718 aa28.6■■■□□ 2.17
ATMIN-201ENST00000299575 EVC2Q86UK5 1308 aa28.59■■■□□ 2.17
ATMIN-201ENST00000299575 MCCP23508 829 aa28.59■■■□□ 2.17
ATMIN-201ENST00000299575 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.58■■■□□ 2.17
ATMIN-201ENST00000299575 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
ATMIN-201ENST00000299575 TOPBP1Q92547 1522 aa28.58■■■□□ 2.17
ATMIN-201ENST00000299575 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.56■■■□□ 2.16
ATMIN-201ENST00000299575 STK31Q9BXU1 1019 aa28.56■■■□□ 2.16
ATMIN-201ENST00000299575 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.56■■■□□ 2.16
ATMIN-201ENST00000299575 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.56■■■□□ 2.16
ATMIN-201ENST00000299575 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
ATMIN-201ENST00000299575 NUTM2FA1L443 756 aa28.55■■■□□ 2.16
ATMIN-201ENST00000299575 STAC3Q96MF2 364 aa28.55■■■□□ 2.16
ATMIN-201ENST00000299575 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
ATMIN-201ENST00000299575 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
ATMIN-201ENST00000299575 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.53■■■□□ 2.16
ATMIN-201ENST00000299575 PLIN1O60240 522 aa28.52■■■□□ 2.16
ATMIN-201ENST00000299575 E9PSI1 815 aa28.52■■■□□ 2.16
ATMIN-201ENST00000299575 DEKP35659 375 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
ATMIN-201ENST00000299575 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.52■■■□□ 2.16
ATMIN-201ENST00000299575 APAF1O14727 1248 aa28.51■■■□□ 2.15
ATMIN-201ENST00000299575 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.5■■■□□ 2.15
ATMIN-201ENST00000299575 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.5■■■□□ 2.15
ATMIN-201ENST00000299575 AMPHP49418 695 aa28.49■■■□□ 2.15
ATMIN-201ENST00000299575 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
ATMIN-201ENST00000299575 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
ATMIN-201ENST00000299575 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.48■■■□□ 2.15
ATMIN-201ENST00000299575 MIA2Q96PC5 1412 aa28.47■■■□□ 2.15
ATMIN-201ENST00000299575 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
ATMIN-201ENST00000299575 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.46■■■□□ 2.15
ATMIN-201ENST00000299575 PLCB2Q00722 1185 aa28.46■■■□□ 2.15
ATMIN-201ENST00000299575 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
ATMIN-201ENST00000299575 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.45■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 NPHP1O15259 732 aa28.45■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 HMMRO75330 724 aa28.43■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa28.43■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.43■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 AFAP1Q8N556 730 aa28.43■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 TIAM1Q13009 1591 aa28.43■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 TAOK2Q9UL54 1235 aa28.42■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 SYNJ2O15056 1496 aa28.42■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.42■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 COG3Q96JB2 828 aa28.41■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 CRBNQ96SW2 442 aa28.41■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.41■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 NGEFQ8N5V2 710 aa28.41■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 HFM1A2PYH4 1435 aa28.41■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa28.4■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 IFT140Q96RY7 1462 aa28.4■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
ATMIN-201ENST00000299575 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
ATMIN-201ENST00000299575 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.37■■■□□ 2.13
ATMIN-201ENST00000299575 GBP4Q96PP9 640 aa28.36■■■□□ 2.13
ATMIN-201ENST00000299575 PDE4AP27815 886 aa28.36■■■□□ 2.13
ATMIN-201ENST00000299575 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.35■■■□□ 2.13
ATMIN-201ENST00000299575 COG6Q9Y2V7 657 aa28.35■■■□□ 2.13
ATMIN-201ENST00000299575 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
ATMIN-201ENST00000299575 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.35■■■□□ 2.13
ATMIN-201ENST00000299575 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.34■■■□□ 2.13
ATMIN-201ENST00000299575 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
ATMIN-201ENST00000299575 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.32■■■□□ 2.12
ATMIN-201ENST00000299575 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
ATMIN-201ENST00000299575 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.31■■■□□ 2.12
ATMIN-201ENST00000299575 FAM161AQ3B820 660 aa28.3■■■□□ 2.12
ATMIN-201ENST00000299575 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
ATMIN-201ENST00000299575 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
ATMIN-201ENST00000299575 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.29■■■□□ 2.12
ATMIN-201ENST00000299575 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.29■■■□□ 2.12
ATMIN-201ENST00000299575 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
ATMIN-201ENST00000299575 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
ATMIN-201ENST00000299575 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa28.28■■■□□ 2.12
ATMIN-201ENST00000299575 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.28■■■□□ 2.12
ATMIN-201ENST00000299575 RUNDC1Q96C34 613 aa28.26■■■□□ 2.11
ATMIN-201ENST00000299575 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.26■■■□□ 2.11
ATMIN-201ENST00000299575 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.25■■■□□ 2.11
ATMIN-201ENST00000299575 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.25■■■□□ 2.11
ATMIN-201ENST00000299575 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.25■■■□□ 2.11
ATMIN-201ENST00000299575 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.24■■■□□ 2.11
ATMIN-201ENST00000299575 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
ATMIN-201ENST00000299575 PTMSP20962 102 aa28.24■■■□□ 2.11
ATMIN-201ENST00000299575 HECW1Q76N89 1606 aa28.23■■■□□ 2.11
ATMIN-201ENST00000299575 RIPK4P57078 832 aa28.23■■■□□ 2.11
ATMIN-201ENST00000299575 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.21■■■□□ 2.11
ATMIN-201ENST00000299575 GPATCH3Q96I76 525 aa28.2■■■□□ 2.1
ATMIN-201ENST00000299575 DAPK1P53355 1430 aa28.19■■■□□ 2.1
ATMIN-201ENST00000299575 ANKRD45Q5TZF3 282 aa28.19■■■□□ 2.1
ATMIN-201ENST00000299575 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
ATMIN-201ENST00000299575 NAIPQ13075 1403 aa28.18■■■□□ 2.1
ATMIN-201ENST00000299575 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.18■■■□□ 2.1
ATMIN-201ENST00000299575 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.17■■■□□ 2.1
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