RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038791.14

Gde1-201, Transcript of Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gde1, Length 1,582 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Myo5cE9Q1F5 1742 aa23.87■■□□□ 1.41
Gde1-201ENSMUST00000038791 Asxl1P59598 1514 aa23.86■■□□□ 1.41
Gde1-201ENSMUST00000038791 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa23.84■■□□□ 1.41
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Kif21bQ9QXL1 1668 aa23.71■■□□□ 1.39
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Cd109Q8R422 1442 aa23.61■■□□□ 1.37
Gde1-201ENSMUST00000038791 Trak1Q6PD31 939 aa23.6■■□□□ 1.37
Gde1-201ENSMUST00000038791 Dip2bQ3UH60 1574 aa23.59■■□□□ 1.37
Gde1-201ENSMUST00000038791 Myom3A2ABU4 1439 aa23.59■■□□□ 1.37
Gde1-201ENSMUST00000038791 Ccer2J3QPU5 274 aa23.57■■□□□ 1.36
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Ttc21bQ0HA38 1315 aa23.56■■□□□ 1.36
Gde1-201ENSMUST00000038791 Brwd3A2AHJ4 1799 aa23.55■■□□□ 1.36
Gde1-201ENSMUST00000038791 Atp7aQ64430 1491 aa23.54■■□□□ 1.36
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Hfm1D3Z4R1 1434 aa23.53■■□□□ 1.36
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Gde1-201ENSMUST00000038791 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa23.51■■□□□ 1.35
Gde1-201ENSMUST00000038791 Ino80Q6ZPV2 1559 aa23.49■■□□□ 1.35
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Pkd2O35245 966 aa23.47■■□□□ 1.35
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa23.47■■□□□ 1.35
Gde1-201ENSMUST00000038791 Tarbp1E9Q368 1579 aa23.45■■□□□ 1.34
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa23.43■■□□□ 1.34
Gde1-201ENSMUST00000038791 Abcc6Q9R1S7 1498 aa23.43■■□□□ 1.34
Gde1-201ENSMUST00000038791 Tecpr2Q3UH45 1423 aa23.42■■□□□ 1.34
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Topaz1E5FYH1 1653 aa23.42■■□□□ 1.34
Gde1-201ENSMUST00000038791 Dot1lQ6XZL8 1540 aa23.41■■□□□ 1.34
Gde1-201ENSMUST00000038791 Abca8aQ8K442 1620 aa23.37■■□□□ 1.33
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Kif13aQ9EQW7 1749 aa23.37■■□□□ 1.33
Gde1-201ENSMUST00000038791 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa23.36■■□□□ 1.33
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Sall3Q62255 1320 aa23.31■■□□□ 1.32
Gde1-201ENSMUST00000038791 Uggt1Q6P5E4 1551 aa23.31■■□□□ 1.32
Gde1-201ENSMUST00000038791 Efcab6Q6P1E8 1516 aa23.31■■□□□ 1.32
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa23.27■■□□□ 1.32
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Usp47Q8BY87 1376 aa23.26■■□□□ 1.31
Gde1-201ENSMUST00000038791 Stk24Q99KH8 431 aa23.26■■□□□ 1.31
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Gde1-201ENSMUST00000038791 AatkQ80YE4 1365 aa23.23■■□□□ 1.31
Gde1-201ENSMUST00000038791 Washc2Q6PGL7 1334 aa23.21■■□□□ 1.31
Gde1-201ENSMUST00000038791 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
Gde1-201ENSMUST00000038791 Scn4aQ9ER60 1841 aa23.2■■□□□ 1.31
Gde1-201ENSMUST00000038791 Rock1P70335 1354 aa23.2■■□□□ 1.3
Gde1-201ENSMUST00000038791 Dip2aQ8BWT5 1523 aa23.17■■□□□ 1.3
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Gde1-201ENSMUST00000038791 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
Gde1-201ENSMUST00000038791 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa23.14■■□□□ 1.29
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