RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034452.11

Ccsap-201, Transcript of Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccsap, Length 2,390 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Bcl11aQ9QYE3 773 aa30.44■■■□□ 2.46
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa30.42■■■□□ 2.46
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Egfem1Q8C088 590 aa30.4■■■□□ 2.46
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Clstn2Q9ER65 966 aa30.4■■■□□ 2.46
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa30.4■■■□□ 2.46
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Jph4Q80WT0 628 aa30.38■■■□□ 2.45
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kank1E9Q238 1360 aa30.38■■■□□ 2.45
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa30.37■■■□□ 2.45
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fancd2Q80V62 1450 aa30.36■■■□□ 2.45
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ssh2Q5SW75 1423 aa30.36■■■□□ 2.45
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Slc4a3P16283 1227 aa30.36■■■□□ 2.45
Ccsap-201ENSMUST00000034452 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa30.35■■■□□ 2.45
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Neo1P97798 1493 aa30.32■■■□□ 2.44
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kcnh8P59111 1102 aa30.32■■■□□ 2.44
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zscan21Q07231 555 aa30.31■■■□□ 2.44
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Setd1aE9PYH6 1716 aa30.3■■■□□ 2.44
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mink1Q9JM52 1308 aa30.29■■■□□ 2.44
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kdm5cP41230 1554 aa30.29■■■□□ 2.44
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Erbb3Q61526 1339 aa30.28■■■□□ 2.44
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cd109Q8R422 1442 aa30.27■■■□□ 2.44
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa30.26■■■□□ 2.43
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa30.26■■■□□ 2.43
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rusc2Q80U22 1514 aa30.25■■■□□ 2.43
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mast1Q9R1L5 1570 aa30.25■■■□□ 2.43
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atp7aQ64430 1491 aa30.25■■■□□ 2.43
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa30.22■■■□□ 2.43
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa30.21■■■□□ 2.43
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Neurl4Q5NCX5 1563 aa30.2■■■□□ 2.43
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Arhgap5P97393 1501 aa30.2■■■□□ 2.43
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa30.2■■■□□ 2.42
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ipo9Q91YE6 1041 aa30.19■■■□□ 2.42
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tarbp1E9Q368 1579 aa30.18■■■□□ 2.42
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Trappc8E9PWG2 1437 aa30.18■■■□□ 2.42
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Q7TT23 1179 aa30.18■■■□□ 2.42
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rnf17Q99MV7 1640 aa30.14■■■□□ 2.42
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pank3Q8R2W9 370 aa30.13■■■□□ 2.41
Ccsap-201ENSMUST00000034452 PrxO55103 1391 aa30.12■■■□□ 2.41
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa30.12■■■□□ 2.41
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zbtb4Q5F293 982 aa30.12■■■□□ 2.41
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cfap74Q3UY96 1578 aa30.1■■■□□ 2.41
Ccsap-201ENSMUST00000034452 NeflP08551 543 aa30.09■■■□□ 2.41
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Adamts13Q769J6 1426 aa30.08■■■□□ 2.41
Ccsap-201ENSMUST00000034452 AknaQ80VW7 1404 aa30.08■■■□□ 2.41
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa30.07■■■□□ 2.4
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ccdc27Q3V036 639 aa30.06■■■□□ 2.4
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Inpp5dQ9ES52 1191 aa30.06■■■□□ 2.4
Ccsap-201ENSMUST00000034452 TnikP83510 1323 aa30.05■■■□□ 2.4
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Plch2A2AP18 1501 aa30.05■■■□□ 2.4
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Fgd6Q69ZL1 1399 aa30.02■■■□□ 2.4
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Zscan10Q3URR7 782 aa30.02■■■□□ 2.4
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tex14Q7M6U3 1450 aa30.02■■■□□ 2.4
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hecw1Q8K4P8 1604 aa30.01■■■□□ 2.39
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Prdm16A2A935 1275 aa30■■■□□ 2.39
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tmf1B9EKI3 1091 aa30■■■□□ 2.39
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa30■■■□□ 2.39
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Robo2Q7TPD3 1470 aa30■■■□□ 2.39
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Pde4cQ3UEI1 686 aa29.97■■■□□ 2.39
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Sbno1Q689Z5 1390 aa29.97■■■□□ 2.39
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa29.97■■■□□ 2.39
Ccsap-201ENSMUST00000034452 AI481877A2ALV5 1481 aa29.95■■■□□ 2.39
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cep170Q6A065 1588 aa29.95■■■□□ 2.39
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Abcc3B2RX12 1523 aa29.95■■■□□ 2.39
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ttc41Q692V3 1318 aa29.93■■■□□ 2.38
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm14025A2AP89 1413 aa29.93■■■□□ 2.38
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa29.91■■■□□ 2.38
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa29.89■■■□□ 2.38
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Tulp4Q9JIL5 1547 aa29.89■■■□□ 2.38
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Esx1O88933 382 aa29.89■■■□□ 2.37
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Nsd2Q8BVE8 1365 aa29.87■■■□□ 2.37
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Srcin1Q9QWI6 1250 aa29.86■■■□□ 2.37
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Kif16bB1AVY7 1312 aa29.86■■■□□ 2.37
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa29.86■■■□□ 2.37
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa29.85■■■□□ 2.37
Ccsap-201ENSMUST00000034452 NhsB1AV60 1647 aa29.85■■■□□ 2.37
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Slc4a1apE9PX68 744 aa29.84■■■□□ 2.37
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa29.81■■■□□ 2.36
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Atf7ipQ7TT18 1306 aa29.81■■■□□ 2.36
Ccsap-201ENSMUST00000034452 Map3k5O35099 1380 aa29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 122.7 ms