RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029047.11

Snx16-201, Transcript of Sorting nexin-16, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Snx16, Length 2,288 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16-201ENSMUST00000029047 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rock1P70335 1354 aa22.4■■□□□ 1.18
Snx16-201ENSMUST00000029047 L3mbtl2P59178 703 aa22.4■■□□□ 1.18
Snx16-201ENSMUST00000029047 Setd1aE9PYH6 1716 aa22.38■■□□□ 1.17
Snx16-201ENSMUST00000029047 Fancd2Q80V62 1450 aa22.38■■□□□ 1.17
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rusc2Q80U22 1514 aa22.36■■□□□ 1.17
Snx16-201ENSMUST00000029047 Neo1P97798 1493 aa22.36■■□□□ 1.17
Snx16-201ENSMUST00000029047 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa22.36■■□□□ 1.17
Snx16-201ENSMUST00000029047 Pak3Q61036 559 aa22.35■■□□□ 1.17
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ssh2Q5SW75 1423 aa22.35■■□□□ 1.17
Snx16-201ENSMUST00000029047 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa22.35■■□□□ 1.17
Snx16-201ENSMUST00000029047 Kdm5cP41230 1554 aa22.33■■□□□ 1.17
Snx16-201ENSMUST00000029047 Jph4Q80WT0 628 aa22.33■■□□□ 1.16
Snx16-201ENSMUST00000029047 Clstn2Q9ER65 966 aa22.33■■□□□ 1.16
Snx16-201ENSMUST00000029047 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
Snx16-201ENSMUST00000029047 Mast1Q9R1L5 1570 aa22.32■■□□□ 1.16
Snx16-201ENSMUST00000029047 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
Snx16-201ENSMUST00000029047 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa22.32■■□□□ 1.16
Snx16-201ENSMUST00000029047 Arhgap5P97393 1501 aa22.29■■□□□ 1.16
Snx16-201ENSMUST00000029047 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Snx16-201ENSMUST00000029047 Kank1E9Q238 1360 aa22.28■■□□□ 1.16
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa22.28■■□□□ 1.16
Snx16-201ENSMUST00000029047 Bcl11aQ9QYE3 773 aa22.28■■□□□ 1.16
Snx16-201ENSMUST00000029047 Slc4a3P16283 1227 aa22.28■■□□□ 1.16
Snx16-201ENSMUST00000029047 Egfem1Q8C088 590 aa22.28■■□□□ 1.16
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rnf17Q99MV7 1640 aa22.28■■□□□ 1.16
Snx16-201ENSMUST00000029047 Cd109Q8R422 1442 aa22.27■■□□□ 1.16
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Snx16-201ENSMUST00000029047 Atp7aQ64430 1491 aa22.27■■□□□ 1.15
Snx16-201ENSMUST00000029047 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa22.26■■□□□ 1.15
Snx16-201ENSMUST00000029047 Tarbp1E9Q368 1579 aa22.25■■□□□ 1.15
Snx16-201ENSMUST00000029047 Neurl4Q5NCX5 1563 aa22.24■■□□□ 1.15
Snx16-201ENSMUST00000029047 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Snx16-201ENSMUST00000029047 Kcnh8P59111 1102 aa22.24■■□□□ 1.15
Snx16-201ENSMUST00000029047 Zscan21Q07231 555 aa22.24■■□□□ 1.15
Snx16-201ENSMUST00000029047 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Snx16-201ENSMUST00000029047 Trappc8E9PWG2 1437 aa22.22■■□□□ 1.15
Snx16-201ENSMUST00000029047 Erbb3Q61526 1339 aa22.22■■□□□ 1.15
Snx16-201ENSMUST00000029047 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa22.21■■□□□ 1.15
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa22.21■■□□□ 1.15
Snx16-201ENSMUST00000029047 Hecw1Q8K4P8 1604 aa22.21■■□□□ 1.15
Snx16-201ENSMUST00000029047 Cfap74Q3UY96 1578 aa22.2■■□□□ 1.14
Snx16-201ENSMUST00000029047 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Snx16-201ENSMUST00000029047 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Snx16-201ENSMUST00000029047 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
Snx16-201ENSMUST00000029047 AknaQ80VW7 1404 aa22.19■■□□□ 1.14
Snx16-201ENSMUST00000029047 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
Snx16-201ENSMUST00000029047 Mink1Q9JM52 1308 aa22.19■■□□□ 1.14
Snx16-201ENSMUST00000029047 Zbtb4Q5F293 982 aa22.18■■□□□ 1.14
Snx16-201ENSMUST00000029047 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Snx16-201ENSMUST00000029047 Q7TT23 1179 aa22.16■■□□□ 1.14
Snx16-201ENSMUST00000029047 Plch2A2AP18 1501 aa22.16■■□□□ 1.14
Snx16-201ENSMUST00000029047 Adamts13Q769J6 1426 aa22.13■■□□□ 1.13
Snx16-201ENSMUST00000029047 PrxO55103 1391 aa22.13■■□□□ 1.13
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa22.13■■□□□ 1.13
Snx16-201ENSMUST00000029047 Cep170Q6A065 1588 aa22.12■■□□□ 1.13
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ipo9Q91YE6 1041 aa22.12■■□□□ 1.13
Snx16-201ENSMUST00000029047 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa22.12■■□□□ 1.13
Snx16-201ENSMUST00000029047 Pank3Q8R2W9 370 aa22.11■■□□□ 1.13
Snx16-201ENSMUST00000029047 Fgd6Q69ZL1 1399 aa22.1■■□□□ 1.13
Snx16-201ENSMUST00000029047 NeflP08551 543 aa22.1■■□□□ 1.13
Snx16-201ENSMUST00000029047 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa22.1■■□□□ 1.13
Snx16-201ENSMUST00000029047 AI481877A2ALV5 1481 aa22.09■■□□□ 1.13
Snx16-201ENSMUST00000029047 Robo2Q7TPD3 1470 aa22.08■■□□□ 1.13
Snx16-201ENSMUST00000029047 Abcc3B2RX12 1523 aa22.07■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Inpp5dQ9ES52 1191 aa22.07■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Tex14Q7M6U3 1450 aa22.07■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 NhsB1AV60 1647 aa22.07■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Gm14025A2AP89 1413 aa22.05■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Zscan10Q3URR7 782 aa22.05■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ak9G3UYQ4 1894 aa22.04■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Tulp4Q9JIL5 1547 aa22.03■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Prdm16A2A935 1275 aa22.03■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 TnikP83510 1323 aa22.03■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Tmf1B9EKI3 1091 aa22.03■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa22.03■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Sbno1Q689Z5 1390 aa22.02■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa22.02■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Pde4cQ3UEI1 686 aa22.02■■□□□ 1.12
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ccdc27Q3V036 639 aa22.01■■□□□ 1.11
Snx16-201ENSMUST00000029047 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa22.01■■□□□ 1.11
Snx16-201ENSMUST00000029047 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Snx16-201ENSMUST00000029047 Abca17E9PX95 1733 aa21.99■■□□□ 1.11
Snx16-201ENSMUST00000029047 ShprhQ7TPQ3 1674 aa21.99■■□□□ 1.11
Snx16-201ENSMUST00000029047 Nsd2Q8BVE8 1365 aa21.98■■□□□ 1.11
Snx16-201ENSMUST00000029047 Abca8bQ8K440 1620 aa21.97■■□□□ 1.11
Snx16-201ENSMUST00000029047 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Snx16-201ENSMUST00000029047 Pola1P33609 1465 aa21.96■■□□□ 1.11
Snx16-201ENSMUST00000029047 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa21.95■■□□□ 1.1
Snx16-201ENSMUST00000029047 Map3k5O35099 1380 aa21.95■■□□□ 1.1
Snx16-201ENSMUST00000029047 Ttc41Q692V3 1318 aa21.95■■□□□ 1.1
Snx16-201ENSMUST00000029047 Chd1P40201 1711 aa21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.2 ms