RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rock1P70335 1354 aa29.64■■■□□ 2.34
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa29.58■■■□□ 2.33
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tarbp1E9Q368 1579 aa29.4■■■□□ 2.3
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa29.27■■■□□ 2.28
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc4a3P16283 1227 aa29.22■■■□□ 2.27
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AI481877A2ALV5 1481 aa29.21■■■□□ 2.27
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PrxO55103 1391 aa29.2■■■□□ 2.27
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa29.19■■■□□ 2.26
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Q7TT23 1179 aa29.18■■■□□ 2.26
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tex14Q7M6U3 1450 aa29.15■■■□□ 2.26
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sbno1Q689Z5 1390 aa29.12■■■□□ 2.25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pde4cQ3UEI1 686 aa29.12■■■□□ 2.25
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Inpp5dQ9ES52 1191 aa29.09■■■□□ 2.25
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ipo9Q91YE6 1041 aa29.06■■■□□ 2.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa29.05■■■□□ 2.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pola1P33609 1465 aa29.05■■■□□ 2.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmf1B9EKI3 1091 aa29.04■■■□□ 2.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kidins220E9Q9B7 1793 aa29.04■■■□□ 2.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttc41Q692V3 1318 aa29.03■■■□□ 2.24
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AnkarA2RT91 1465 aa29.01■■■□□ 2.23
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ak9G3UYQ4 1894 aa28.99■■■□□ 2.23
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