RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa18.8■□□□□ 0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Abcc3B2RX12 1523 aa18.8■□□□□ 0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Abca8bQ8K440 1620 aa18.8■□□□□ 0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Neurl4Q5NCX5 1563 aa18.8■□□□□ 0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znf608Q56A10 1511 aa18.8■□□□□ 0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa18.8■□□□□ 0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mrs2Q5NCE8 434 aa18.8■□□□□ 0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cd109Q8R422 1442 aa18.79■□□□□ 0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plekhg5Q66T02 1073 aa18.79■□□□□ 0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Atp7aQ64430 1491 aa18.78■□□□□ 0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Exoc6Q8R313 802 aa18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Washc2Q6PGL7 1334 aa18.77■□□□□ 0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rock1P70335 1354 aa18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hecw1Q8K4P8 1604 aa18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Map3k5O35099 1380 aa18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Polr3aB2RXC6 1390 aa18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AI481877A2ALV5 1481 aa18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prdm16A2A935 1275 aa18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tarbp1E9Q368 1579 aa18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pde4cQ3UEI1 686 aa18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igf1rQ60751 1373 aa18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kidins220E9Q9B7 1793 aa18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Robo2Q7TPD3 1470 aa18.66■□□□□ 0.58
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CenpbP27790 599 aa18.66■□□□□ 0.58
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NrdcQ8BHG1 1161 aa18.65■□□□□ 0.58
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PtprtQ99M80 1454 aa18.65■□□□□ 0.58
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zbtb4Q5F293 982 aa18.63■□□□□ 0.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rock2P70336 1388 aa18.63■□□□□ 0.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa18.63■□□□□ 0.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa18.63■□□□□ 0.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ShprhQ7TPQ3 1674 aa18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arid3cA6PWV5 409 aa18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Adamts13Q769J6 1426 aa18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cep170Q6A065 1588 aa18.61■□□□□ 0.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfyve16Q80U44 1528 aa18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Calr4Q3TQS0 420 aa18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Abca17E9PX95 1733 aa18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa18.57■□□□□ 0.56
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Abca9Q8K449 1623 aa18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Erich6D3Z6S9 713 aa18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa18.56■□□□□ 0.56
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nsd2Q8BVE8 1365 aa18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kif3bQ61771 747 aa18.55■□□□□ 0.56
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kdm5cP41230 1554 aa18.53■□□□□ 0.56
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nos1Q9Z0J4 1429 aa18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lemd3Q9WU40 921 aa18.52■□□□□ 0.56
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sall3Q62255 1320 aa18.52■□□□□ 0.55
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tulp4Q9JIL5 1547 aa18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Setd1aE9PYH6 1716 aa18.51■□□□□ 0.55
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Myo5cE9Q1F5 1742 aa18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P3h3Q8CG70 732 aa18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa18.49■□□□□ 0.55
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa18.48■□□□□ 0.55
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Abcc6Q9R1S7 1498 aa18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kdm2aP59997 1161 aa18.46■□□□□ 0.55
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ttc21bQ0HA38 1315 aa18.45■□□□□ 0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pank3Q8R2W9 370 aa18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PrxO55103 1391 aa18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fndc1E9Q043 1732 aa18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ofd1Q80Z25 1017 aa18.43■□□□□ 0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Abca6Q8K441 1624 aa18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Inpp5dQ9ES52 1191 aa18.42■□□□□ 0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AnkarA2RT91 1465 aa18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Uggt2E9Q4X2 1504 aa18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stk24Q99KH8 431 aa18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa18.4■□□□□ 0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Srcin1Q9QWI6 1250 aa18.39■□□□□ 0.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q7TT23 1179 aa18.38■□□□□ 0.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 OvosQ3UU35 1456 aa18.37■□□□□ 0.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Anp32aO35381 247 aa18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ErbinQ80TH2 1402 aa18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Iqgap3F8VQ29 1632 aa18.36■□□□□ 0.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zscan10Q3URR7 782 aa18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Os9Q8K2C7 672 aa18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Col17a1Q07563 1470 aa18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam71e1A1L3C1 212 aa18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20521D3Z5F7 333 aa18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zscan21Q07231 555 aa18.34■□□□□ 0.53
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prex1Q69ZK0 1650 aa18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.7 ms