RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021338.9

Ap4s1-201, Transcript of AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ap4s1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 AlkP97793 1621 aa28.32■■■□□ 2.12
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Kif3bQ61771 747 aa28.31■■■□□ 2.12
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Trpm2Q91YD4 1506 aa28.31■■■□□ 2.12
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 ShprhQ7TPQ3 1674 aa28.29■■■□□ 2.12
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ccer2J3QPU5 274 aa28.24■■■□□ 2.11
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Myo5cE9Q1F5 1742 aa28.23■■■□□ 2.11
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Naip5Q9R016 1403 aa28.2■■■□□ 2.11
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Myom2Q14BI5 1463 aa28.2■■■□□ 2.1
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Robo2Q7TPD3 1470 aa28.2■■■□□ 2.1
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Pde4cQ3UEI1 686 aa28.16■■■□□ 2.1
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Abca6Q8K441 1624 aa28.15■■■□□ 2.1
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Map4P27546 1125 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Adamts7Q68SA9 1657 aa28.13■■■□□ 2.09
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Afap1Q80YS6 731 aa28.13■■■□□ 2.09
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 RictorQ6QI06 1708 aa28.12■■■□□ 2.09
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Mier1Q5UAK0 511 aa28.12■■■□□ 2.09
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Prex1Q69ZK0 1650 aa28.1■■■□□ 2.09
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ube2uB1AUC4 352 aa28.1■■■□□ 2.09
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Nsd2Q8BVE8 1365 aa28.1■■■□□ 2.09
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Knl1Q66JQ7 1612 aa28.09■■■□□ 2.09
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 PtprgQ05909 1442 aa28.09■■■□□ 2.09
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Zfp644E9QA22 1323 aa28.08■■■□□ 2.09
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa28.06■■■□□ 2.08
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa28.05■■■□□ 2.08
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Asxl1P59598 1514 aa28.04■■■□□ 2.08
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Myom3A2ABU4 1439 aa28.03■■■□□ 2.08
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ttll5Q8CHB8 1328 aa28.03■■■□□ 2.08
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Kif21bQ9QXL1 1668 aa28.03■■■□□ 2.08
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 AnkarA2RT91 1465 aa28.02■■■□□ 2.08
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa28.01■■■□□ 2.07
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Hfm1D3Z4R1 1434 aa27.99■■■□□ 2.07
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Cd109Q8R422 1442 aa27.99■■■□□ 2.07
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Dip2bQ3UH60 1574 aa27.98■■■□□ 2.07
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Mphosph9A6H5Y1 991 aa27.97■■■□□ 2.07
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Akap12Q9WTQ5 1684 aa27.96■■■□□ 2.07
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Brwd3A2AHJ4 1799 aa27.96■■■□□ 2.07
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Bcl9Q9D219 1425 aa27.95■■■□□ 2.07
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 PtprmP28828 1452 aa27.95■■■□□ 2.06
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa27.94■■■□□ 2.06
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ttc21bQ0HA38 1315 aa27.93■■■□□ 2.06
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Tarbp1E9Q368 1579 aa27.91■■■□□ 2.06
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Trak1Q6PD31 939 aa27.9■■■□□ 2.06
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa27.9■■■□□ 2.06
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Abcc6Q9R1S7 1498 aa27.89■■■□□ 2.06
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Tecpr2Q3UH45 1423 aa27.88■■■□□ 2.05
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ino80Q6ZPV2 1559 aa27.86■■■□□ 2.05
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 MyclP10166 368 aa27.85■■■□□ 2.05
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa27.83■■■□□ 2.05
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa27.82■■■□□ 2.04
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Atp7aQ64430 1491 aa27.82■■■□□ 2.04
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa27.81■■■□□ 2.04
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Uggt1Q6P5E4 1551 aa27.81■■■□□ 2.04
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Iqgap3F8VQ29 1632 aa27.81■■■□□ 2.04
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Gm13697A2AK42 830 aa27.77■■■□□ 2.04
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Pkd2O35245 966 aa27.76■■■□□ 2.03
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Skint5A7XUY5 1461 aa27.75■■■□□ 2.03
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa27.75■■■□□ 2.03
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Efcab6Q6P1E8 1516 aa27.72■■■□□ 2.03
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Topaz1E5FYH1 1653 aa27.72■■■□□ 2.03
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Abca8aQ8K442 1620 aa27.67■■■□□ 2.02
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Pik3c2gO70167 1506 aa27.67■■■□□ 2.02
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa27.66■■■□□ 2.02
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 ErbinQ80TH2 1402 aa27.65■■■□□ 2.02
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Dot1lQ6XZL8 1540 aa27.64■■■□□ 2.02
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Rock1P70335 1354 aa27.63■■■□□ 2.01
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa27.61■■■□□ 2.01
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa27.58■■■□□ 2.01
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Mroh1E0CZ22 1640 aa27.56■■■□□ 2
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Kif13aQ9EQW7 1749 aa27.56■■■□□ 2
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Cyb5rlB1AS42 316 aa27.56■■■□□ 2
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Erich6D3Z6S9 713 aa27.56■■■□□ 2
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa27.54■■■□□ 2
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Naip7Q9JIB3 1402 aa27.54■■■□□ 2
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Usp47Q8BY87 1376 aa27.53■■■□□ 2
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Eid3Q3V124 375 aa27.52■■■□□ 2
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 NefmP08553 848 aa27.51■■□□□ 1.99
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa27.49■■□□□ 1.99
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Dip2aQ8BWT5 1523 aa27.48■■□□□ 1.99
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 Stk24Q99KH8 431 aa27.48■■□□□ 1.99
Ap4s1-201ENSMUST00000021338 AatkQ80YE4 1365 aa27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 95.5 ms