RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adgrl3Q80TS3 1537 aa27.72■■■□□ 2.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cd109Q8R422 1442 aa27.7■■■□□ 2.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mug2P28666 1451 aa27.7■■■□□ 2.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Abca9Q8K449 1623 aa27.67■■■□□ 2.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dapk1Q80YE7 1442 aa27.66■■■□□ 2.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Col17a1Q07563 1470 aa27.66■■■□□ 2.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atp7aQ64430 1491 aa27.66■■■□□ 2.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Myom3A2ABU4 1439 aa27.64■■■□□ 2.01
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rock1P70335 1354 aa27.61■■■□□ 2.01
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Abca17E9PX95 1733 aa27.6■■■□□ 2.01
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Robo2Q7TPD3 1470 aa27.6■■■□□ 2.01
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pde4cQ3UEI1 686 aa27.6■■■□□ 2.01
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rundc1Q0VDN7 615 aa27.58■■■□□ 2.01
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ShprhQ7TPQ3 1674 aa27.57■■■□□ 2
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tarbp1E9Q368 1579 aa27.56■■■□□ 2
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Washc2Q6PGL7 1334 aa27.55■■■□□ 2
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Naip6Q9JIB6 1403 aa27.54■■■□□ 2
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ak9G3UYQ4 1894 aa27.52■■■□□ 2
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Card11Q8CIS0 1159 aa27.52■■■□□ 2
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa27.51■■□□□ 1.99
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Polr3aB2RXC6 1390 aa27.5■■□□□ 1.99
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lemd3Q9WU40 921 aa27.5■■□□□ 1.99
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nos1Q9Z0J4 1429 aa27.49■■□□□ 1.99
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa27.48■■□□□ 1.99
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nsd2Q8BVE8 1365 aa27.44■■□□□ 1.98
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Myo5cE9Q1F5 1742 aa27.42■■□□□ 1.98
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kif3bQ61771 747 aa27.42■■□□□ 1.98
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa27.39■■□□□ 1.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa27.39■■□□□ 1.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Stra8P70278 393 aa27.37■■□□□ 1.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adamts13Q769J6 1426 aa27.37■■□□□ 1.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 OvosQ3UU35 1456 aa27.37■■□□□ 1.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Plekhg5Q66T02 1073 aa27.37■■□□□ 1.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Csrnp3P59055 597 aa27.34■■□□□ 1.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Erich6D3Z6S9 713 aa27.33■■□□□ 1.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fndc1E9Q043 1732 aa27.33■■□□□ 1.97
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa27.32■■□□□ 1.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kdm5cP41230 1554 aa27.32■■□□□ 1.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Abca6Q8K441 1624 aa27.31■■□□□ 1.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm13695A2AK44 830 aa27.31■■□□□ 1.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Depdc5P61460 1591 aa27.29■■□□□ 1.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa27.28■■□□□ 1.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rock2P70336 1388 aa27.28■■□□□ 1.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tulp4Q9JIL5 1547 aa27.28■■□□□ 1.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa27.28■■□□□ 1.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa27.27■■□□□ 1.96
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa27.26■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AnkarA2RT91 1465 aa27.26■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf710Q3U288 666 aa27.26■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atp10aO54827 1508 aa27.25■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ptch1Q61115 1434 aa27.25■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Abcc6Q9R1S7 1498 aa27.25■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AglF8VPN4 1532 aa27.24■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ttc21bQ0HA38 1315 aa27.23■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sall3Q62255 1320 aa27.23■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Plch2A2AP18 1501 aa27.23■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mrs2Q5NCE8 434 aa27.23■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc24a1Q91WD8 1130 aa27.22■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Uggt2E9Q4X2 1504 aa27.21■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zbtb4Q5F293 982 aa27.21■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Exoc6Q8R313 802 aa27.21■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prex1Q69ZK0 1650 aa27.21■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa27.2■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gli2Q0VGT2 1544 aa27.2■■□□□ 1.95
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Iqgap3F8VQ29 1632 aa27.19■■□□□ 1.94
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ttc37F8VPK0 1563 aa27.17■■□□□ 1.94
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dip2cE9PWR4 1557 aa27.16■■□□□ 1.94
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Setd1aE9PYH6 1716 aa27.16■■□□□ 1.94
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa27.16■■□□□ 1.94
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tnnt3Q9QZ47 272 aa27.14■■□□□ 1.94
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RereQ80TZ9 1558 aa27.13■■□□□ 1.93
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ErbinQ80TH2 1402 aa27.13■■□□□ 1.93
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kiaa0556Q8C753 1610 aa27.1■■□□□ 1.93
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Stk24Q99KH8 431 aa27.1■■□□□ 1.93
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Abca8aQ8K442 1620 aa27.1■■□□□ 1.93
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AdgbG3UZ78 1657 aa27.09■■□□□ 1.93
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kdm2aP59997 1161 aa27.07■■□□□ 1.92
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa27.05■■□□□ 1.92
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 NrdcQ8BHG1 1161 aa27.03■■□□□ 1.92
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa27.03■■□□□ 1.92
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Yeats2Q3TUF7 1407 aa27.02■■□□□ 1.92
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AatkQ80YE4 1365 aa27.01■■□□□ 1.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.1 ms