RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001172.11

Ankrd39-201, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd39, Length 2,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Arid3cA6PWV5 409 aa25.04■■□□□ 1.6
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Dapk1Q80YE7 1442 aa25.03■■□□□ 1.6
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rock1P70335 1354 aa25.03■■□□□ 1.6
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Atp7aQ64430 1491 aa25.02■■□□□ 1.6
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cep170Q6A065 1588 aa25.02■■□□□ 1.6
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Abca9Q8K449 1623 aa25.02■■□□□ 1.6
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Myom3A2ABU4 1439 aa25■■□□□ 1.59
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Pde4cQ3UEI1 686 aa25■■□□□ 1.59
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Robo2Q7TPD3 1470 aa24.99■■□□□ 1.59
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Abca17E9PX95 1733 aa24.97■■□□□ 1.59
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rundc1Q0VDN7 615 aa24.96■■□□□ 1.59
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 ShprhQ7TPQ3 1674 aa24.94■■□□□ 1.58
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Polr3aB2RXC6 1390 aa24.93■■□□□ 1.58
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Washc2Q6PGL7 1334 aa24.92■■□□□ 1.58
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tarbp1E9Q368 1579 aa24.92■■□□□ 1.58
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Naip6Q9JIB6 1403 aa24.92■■□□□ 1.58
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Lemd3Q9WU40 921 aa24.91■■□□□ 1.58
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa24.91■■□□□ 1.58
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Card11Q8CIS0 1159 aa24.9■■□□□ 1.58
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Nos1Q9Z0J4 1429 aa24.9■■□□□ 1.58
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa24.88■■□□□ 1.57
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Nsd2Q8BVE8 1365 aa24.85■■□□□ 1.57
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gm156Q58A37 223 aa24.85■■□□□ 1.57
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Plekhg5Q66T02 1073 aa24.83■■□□□ 1.57
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Kif3bQ61771 747 aa24.82■■□□□ 1.56
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Stra8P70278 393 aa24.8■■□□□ 1.56
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Myo5cE9Q1F5 1742 aa24.79■■□□□ 1.56
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa24.78■■□□□ 1.56
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Adamts13Q769J6 1426 aa24.77■■□□□ 1.56
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 OvosQ3UU35 1456 aa24.77■■□□□ 1.56
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ak9G3UYQ4 1894 aa24.75■■□□□ 1.55
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Kdm5cP41230 1554 aa24.73■■□□□ 1.55
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gm13695A2AK44 830 aa24.73■■□□□ 1.55
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Fndc1E9Q043 1732 aa24.72■■□□□ 1.55
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Rock2P70336 1388 aa24.72■■□□□ 1.55
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa24.71■■□□□ 1.55
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa24.7■■□□□ 1.54
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Atp10aO54827 1508 aa24.68■■□□□ 1.54
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa24.68■■□□□ 1.54
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Erich6D3Z6S9 713 aa24.68■■□□□ 1.54
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Znf710Q3U288 666 aa24.68■■□□□ 1.54
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 AnkarA2RT91 1465 aa24.68■■□□□ 1.54
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ttc21bQ0HA38 1315 aa24.68■■□□□ 1.54
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa24.68■■□□□ 1.54
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Abca6Q8K441 1624 aa24.67■■□□□ 1.54
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Csrnp3P59055 597 aa24.67■■□□□ 1.54
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 AglF8VPN4 1532 aa24.67■■□□□ 1.54
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tulp4Q9JIL5 1547 aa24.67■■□□□ 1.54
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Adgrl3Q80TS3 1537 aa24.66■■□□□ 1.54
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Plch2A2AP18 1501 aa24.65■■□□□ 1.54
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Ptch1Q61115 1434 aa24.64■■□□□ 1.54
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Abcc6Q9R1S7 1498 aa24.63■■□□□ 1.53
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Col17a1Q07563 1470 aa24.63■■□□□ 1.53
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Uggt2E9Q4X2 1504 aa24.62■■□□□ 1.53
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Sall3Q62255 1320 aa24.62■■□□□ 1.53
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa24.61■■□□□ 1.53
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Mrs2Q5NCE8 434 aa24.6■■□□□ 1.53
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Setd1aE9PYH6 1716 aa24.6■■□□□ 1.53
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Exoc6Q8R313 802 aa24.59■■□□□ 1.53
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Gli2Q0VGT2 1544 aa24.59■■□□□ 1.53
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Prex1Q69ZK0 1650 aa24.59■■□□□ 1.53
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tnnt3Q9QZ47 272 aa24.58■■□□□ 1.53
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Iqgap3F8VQ29 1632 aa24.58■■□□□ 1.53
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Depdc5P61460 1591 aa24.57■■□□□ 1.52
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa24.57■■□□□ 1.52
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Kiaa0556Q8C753 1610 aa24.56■■□□□ 1.52
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Dip2cE9PWR4 1557 aa24.55■■□□□ 1.52
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 ErbinQ80TH2 1402 aa24.55■■□□□ 1.52
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Slc24a1Q91WD8 1130 aa24.55■■□□□ 1.52
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 RereQ80TZ9 1558 aa24.53■■□□□ 1.52
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Zbtb4Q5F293 982 aa24.52■■□□□ 1.52
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Abca8aQ8K442 1620 aa24.51■■□□□ 1.51
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Stk24Q99KH8 431 aa24.5■■□□□ 1.51
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 AdgbG3UZ78 1657 aa24.48■■□□□ 1.51
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Kdm2aP59997 1161 aa24.48■■□□□ 1.51
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa24.47■■□□□ 1.51
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 AatkQ80YE4 1365 aa24.46■■□□□ 1.51
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 NrdcQ8BHG1 1161 aa24.45■■□□□ 1.5
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa24.44■■□□□ 1.5
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Yeats2Q3TUF7 1407 aa24.42■■□□□ 1.5
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Srcin1Q9QWI6 1250 aa24.42■■□□□ 1.5
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Trpm1Q2TV84 1622 aa24.41■■□□□ 1.5
Ankrd39-201ENSMUST00000001172 Tecpr2Q3UH45 1423 aa24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8.5 ms