RNA–Protein interactions for RNA: YGR019W

UGA1, Transcript of Gamma-aminobutyrate (GABA) transaminase, yeast

Gene UGA1, Length 1,416 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UGA1	YGR019W	THI2	P38141	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	FMP23	P38231	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	RCY1	P39531	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	COG3	P40094	801 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YER186C	P40101	306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SOK1	P40317	901 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YKE4	P40544	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	FKH2	P41813	862 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	HXT14	P42833	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SER2	P42941	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	PET130	P47065	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YGL185C	P53100	379 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YGL114W	P53134	725 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	NUP49	Q02199	472 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	NHP10	Q03435	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	XYL2	Q07993	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YPR1	Q12458	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	PDE2	P06776	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YCR099C	P25657	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	RML2	P32611	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	TOD6	P34219	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	APT2	P36973	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	POA1	P38218	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	ATG7	P38862	630 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	DDI1	P40087	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	PRY1	P47032	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YHC3	P47040	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	IBA57	P47158	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	NAS6	P50086	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	MRH4	P53166	561 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YGR168C	P53293	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	DIA1	P54005	336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	MSC2	Q03455	724 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	DLT1	Q04216	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	COX20	Q04935	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	PEX27	Q08580	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	DDC1	Q08949	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	MLH3	Q12083	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
UGA1	YGR019W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	RPN6	Q12377	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	RTR2	Q12378	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YUR1	P26725	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	GAC1	P28006	793 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	PET127	P32606	800 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	MTC7	P32633	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	ZRT3	P34240	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	ARP1	P38696	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	ELO3	P40319	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	AYR1	P40471	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	OPT1	P40897	799 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	COX16	P47081	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SCS3	P53012	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
UGA1	YGR019W	CDC14	Q00684	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SKO1	Q02100	647 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	EMI1	Q04406	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	CTS2	Q06350	511 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	AIM6	Q07716	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	ATG31	Q12421	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SFG1	Q12507	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	DST1	P07273	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	ATG22	P25568	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	PEX34	P25584	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YIH1	P25637	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	CPR5	P35176	225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	EFM1	P38732	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	GID8	P40208	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
UGA1	YGR019W	CDC1	P40986	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	MNN5	P46982	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	SSY5	P47002	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	IRC18	P47056	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	APS3	P47064	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UGA1	YGR019W	YGR149W	P48236	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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