RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 MCTP1Q6DN14 999 aa26.8■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 FBXO22Q8NEZ5 403 aa26.8■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 GDPD5Q8WTR4 605 aa26.8■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 C1orf112Q9NSG2 853 aa26.8■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 LRFN2Q9ULH4 789 aa26.8■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 MTCH2Q9Y6C9 303 aa26.8■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 H3BQV1 296 aa26.79■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 ZBTB39O15060 712 aa26.79■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 DGKIO75912 1065 aa26.79■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 DARSP14868 501 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 SARSP49591 514 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 NBR1Q14596 966 aa26.79■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 RHPN2Q8IUC4 686 aa26.79■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 SAMD11Q96NU1 681 aa26.79■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 RGS18Q9NS28 235 aa26.79■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa26.79■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa26.79■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 LPXNO60711 386 aa26.78■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 LYPLA2O95372 231 aa26.78■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 TECP42680 631 aa26.78■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 SLC24A5Q71RS6 500 aa26.78■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 CRIPAKQ8N1N5 446 aa26.78■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 COL4A6Q14031 1691 aa26.77■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 A0A087WZ62 844 aa26.77■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 EPC2Q52LR7 807 aa26.77■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM192Q8IY95 271 aa26.77■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM143Q96AN5 459 aa26.77■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa26.77■■□□□ 1.88
SMKR1-201ENST00000462322 C9IYK1 514 aa26.76■■□□□ 1.87
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SMKR1-201ENST00000462322 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 FGFR4P22455 802 aa26.76■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 DSC3Q14574 896 aa26.76■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 EMC2Q15006 297 aa26.76■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF410Q86VK4 478 aa26.76■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 KSR1Q8IVT5 923 aa26.76■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 NLRP4Q96MN2 994 aa26.76■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 ANKEF1Q9NU02 776 aa26.76■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 ERMNQ8TAM6 284 aa26.75■■□□□ 1.87
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SMKR1-201ENST00000462322 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa26.75■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.75■■□□□ 1.87
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SMKR1-201ENST00000462322 A0A0C4DFX4 3053 aa26.75■■□□□ 1.87
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SMKR1-201ENST00000462322 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.74■■□□□ 1.87
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SMKR1-201ENST00000462322 TCP11Q8WWU5 503 aa26.74■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 MTRQ99707 1265 aa26.74■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 TUFT1Q9NNX1 390 aa26.74■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 LMCD1Q9NZU5 365 aa26.74■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa26.73■■□□□ 1.87
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SMKR1-201ENST00000462322 CTNNB1P35222 781 aa26.73■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 PTGDRQ13258 359 aa26.73■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 CATSPER3Q86XQ3 398 aa26.73■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 PRDM6Q9NQX0 595 aa26.73■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 RWDD3Q9Y3V2 267 aa26.73■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 A0A087WWV3 80 aa26.72■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 MED24O75448 989 aa26.72■■□□□ 1.87
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SMKR1-201ENST00000462322 FAM189BP81408 668 aa26.72■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa26.72■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 GPM6BQ13491 265 aa26.72■■□□□ 1.87
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SMKR1-201ENST00000462322 RILPL1Q5EBL4 403 aa26.72■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa26.72■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM161AQ9NX61 479 aa26.72■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 UNC80Q8N2C7 3258 aa26.71■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 NLRC5Q86WI3 1866 aa26.71■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 H3BNC9 293 aa26.71■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 ASAP2O43150 1006 aa26.71■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 DGAT1O75907 488 aa26.71■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 BMPR1AP36894 532 aa26.71■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 RARRES1P49788 294 aa26.71■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SMKR1-201ENST00000462322 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
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