RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 PRCPP42785 496 aa26.89■■□□□ 1.9
CTU1-201ENST00000421832 DUSP28Q4G0W2 176 aa26.89■■□□□ 1.9
CTU1-201ENST00000421832 XKR9Q5GH70 373 aa26.89■■□□□ 1.9
CTU1-201ENST00000421832 TRIB2Q92519 343 aa26.89■■□□□ 1.9
CTU1-201ENST00000421832 RABGGTAQ92696 567 aa26.89■■□□□ 1.9
CTU1-201ENST00000421832 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa26.89■■□□□ 1.9
CTU1-201ENST00000421832 GPR25O00155 361 aa26.89■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 RPS6KA5O75582 802 aa26.89■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 ACTN2P35609 894 aa26.89■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 ZHX3Q9H4I2 956 aa26.89■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 ANKEF1Q9NU02 776 aa26.89■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 TBC1D7Q9P0N9 293 aa26.89■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa26.89■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 SFI1A8K8P3 1242 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 KIF22Q14807 665 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 NCAPHQ15003 741 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 IQSEC1Q6DN90 963 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 CBFA2T2O43439 604 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 USO1O60763 962 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 STAT5BP51692 787 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 TNFAIP2Q03169 654 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 LAMC2Q13753 1193 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 MAEAQ7L5Y9 396 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 AFG1LQ8WV93 481 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 FUT8Q9BYC5 575 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 LGR5O75473 907 aa26.87■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 CCDC65Q8IXS2 484 aa26.87■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 AFAP1L1Q8TED9 768 aa26.87■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 ADAM21Q9UKJ8 722 aa26.87■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa26.87■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 STX17P56962 302 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 BRD3Q15059 726 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 DAW1Q8N136 415 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 ADSSL1Q8N142 457 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 TRPV1Q8NER1 839 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 TSKSQ9UJT2 592 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 OATP04181 439 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 TRIM32Q13049 653 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 MAPK7Q13164 816 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 LRRC41Q15345 812 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 XKR3Q5GH77 459 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 SFR1Q86XK3 245 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 CEP170P1Q96L14 293 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 DACH1Q9UI36 760 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 CTNND2Q9UQB3 1225 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 MARK3P27448 753 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 FAM26FQ5R3K3 315 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 FAM160B1Q5W0V3 765 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 GLG1Q92896 1179 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 CCDC151A5D8V7 595 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 MAP2K7O14733 419 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 GUCY2CP25092 1073 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 OTUD6AQ7L8S5 288 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 C10orf67Q8IYJ2 551 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 OR6J1Q8NGC5 347 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 PPTC7Q8NI37 304 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 HSD3B7Q9H2F3 369 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 AZI2Q9H6S1 392 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 KCND2Q9NZV8 630 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 HIP1RO75146 1068 aa26.84■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 MTERF2Q49AM1 385 aa26.84■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 CYP26B1Q9NR63 512 aa26.84■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 EMSYQ7Z589 1322 aa26.84■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 TBCAO75347 108 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 ELNP15502 786 aa26.83■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 HSPA6P17066 643 aa26.83■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 FANCCQ00597 558 aa26.83■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 ICE2Q659A1 982 aa26.83■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 GPRC5CQ9NQ84 441 aa26.83■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 SRRDQ9UH36 339 aa26.83■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 CASP5P51878 434 aa26.83■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 SOX10P56693 466 aa26.83■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 TUBB4BP68371 445 aa26.83■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 MYL5Q02045 173 aa26.83■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 IRF5Q13568 498 aa26.83■■□□□ 1.89
CTU1-201ENST00000421832 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 ARHGAP6O43182 974 aa26.82■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 FAM13AO94988 1023 aa26.82■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 LGALS2P05162 132 aa26.82■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 PMS1P54277 932 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 PSMD2Q13200 908 aa26.82■■□□□ 1.88
CTU1-201ENST00000421832 LEKR1Q6ZMV7 388 aa26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.5 ms