RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trim9Q8C7M3 817 aa24.14■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pde5aQ8CG03 865 aa24.14■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prrg2Q8R182 198 aa24.14■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adam33Q923W9 797 aa24.14■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 BccipQ9CWI3 316 aa24.14■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem206Q9D771 350 aa24.14■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Capns2Q9D7J7 247 aa24.14■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PdcQ9QW08 244 aa24.14■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cd68P31996 326 aa24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rrp1P56183 494 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wdr5P61965 334 aa24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hoxb13P70321 286 aa24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hhla1Q3TYV2 514 aa24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MaeaQ4VC33 396 aa24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mief2Q5NCS9 454 aa24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem199Q5SYH2 208 aa24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 F13a1Q8BH61 732 aa24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm5591Q8CDK1 855 aa24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rtfdc1Q99K95 307 aa24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pstpip2Q99M15 334 aa24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ddah1Q9CWS0 285 aa24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Asah2Q9JHE3 756 aa24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Msl3Q9WVG9 525 aa24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PcntP48725 2898 aa24.13■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Diaph1O08808 1255 aa24.12■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 GclmO09172 274 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Axin1O35625 863 aa24.12■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdc6O89033 562 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Surf1P09925 306 aa24.12■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scp2P32020 547 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmod1P49813 359 aa24.12■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Grxcr1Q50H32 290 aa24.12■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rsad1Q5SUV1 442 aa24.12■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa24.12■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcdhb15Q91Y04 786 aa24.12■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TtpalQ9D3D0 343 aa24.12■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TnmdQ9EP64 317 aa24.12■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dusp10Q9ESS0 483 aa24.12■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcdh11xF6ZNL5 1338 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Piezo1E2JF22 2547 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Akap17bA2A3V1 959 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm13941A2AJ38 245 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ankrd16A2AS55 361 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AurkbO70126 345 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tal1P22091 329 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tnni3P48787 211 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Clcn3P51791 818 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sema5bQ60519 1093 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Asic1Q6NXK8 526 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Caps2Q8BUG5 550 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Apol10aQ8CCA5 318 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kiaa0391Q8JZY4 584 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rpap2Q8VC34 614 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr395Q8VGR3 312 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 GhdcQ99J23 532 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nrbp1Q99J45 535 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrp2bpQ9D4C6 346 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrrc46Q9DAP0 323 aa24.11■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CluhQ5SW19 1315 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc6a16A0A1L1SR47 742 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm6133B2RY53 190 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mctp1E9PV86 951 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm4841E9QAA8 417 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Il1rapl1P59823 695 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 LbpQ61805 481 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Msantd2Q6NZR2 559 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PodnQ7TQ62 611 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igdcc3Q8BQC3 813 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 4933409G03RikQ8C5U0 320 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ildr1Q8CBR1 537 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mettl24Q8CCB5 363 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mamdc2Q8CG85 686 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Polr3fQ921X6 316 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Drc3Q9D5E4 523 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PorcnQ9JJJ7 461 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hs6st3Q9QYK4 470 aa24.1■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm4907B1AXB9 411 aa24.09■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arhgef26D3YYY8 869 aa24.09■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rnaseh1O70338 285 aa24.09■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp11b2P15539 500 aa24.09■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ProcP33587 460 aa24.09■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nol4P60954 483 aa24.09■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fgfr4Q03142 799 aa24.09■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mkrn3Q60764 544 aa24.09■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tcf12Q61286 706 aa24.09■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rexo1Q7TT28 1213 aa24.09■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Large1Q9Z1M7 756 aa24.09■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bdp1Q571C7 2467 aa24.08■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 A0A1L1SQF0 893 aa24.08■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm7168A0AUV4 508 aa24.08■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cul4bA2A432 970 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bpifb4A2BGH0 617 aa24.08■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ace3D0G895 737 aa24.08■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm3252E9PUT9 216 aa24.08■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm3468E9QAJ8 216 aa24.08■■□□□ 1.45
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gnrh1P13562 90 aa24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.2 ms