Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
Tmod1P49813 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Tmod1P49813 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Tmod1P49813 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Tmod1P49813 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Tmod1P49813 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Tmod1P49813 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Tmod1P49813 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Tmod1P49813 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Tmod1P49813 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Tmod1P49813 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Tmod1P49813 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Tmod1P49813 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Tmod1P49813 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Tmod1P49813 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Tmod1P49813 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Tmod1P49813 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Tmod1P49813 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Tmod1P49813 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Tmod1P49813 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Tmod1P49813 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Tmod1P49813 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Tmod1P49813 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Tmod1P49813 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Tmod1P49813 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Tmod1P49813 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Tmod1P49813 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Tmod1P49813 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Tmod1P49813 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Tmod1P49813 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Tmod1P49813 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Tmod1P49813 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Tmod1P49813 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Tmod1P49813 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Tmod1P49813 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Tmod1P49813 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Tmod1P49813 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Tmod1P49813 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Tmod1P49813 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Tmod1P49813 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Tmod1P49813 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Tmod1P49813 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Tmod1P49813 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Tmod1P49813 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Tmod1P49813 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Tmod1P49813 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Tmod1P49813 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Tmod1P49813 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Tmod1P49813 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Tmod1P49813 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tmod1P49813 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Tmod1P49813 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Tmod1P49813 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tmod1P49813 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tmod1P49813 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tmod1P49813 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tmod1P49813 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tmod1P49813 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Tmod1P49813 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Tmod1P49813 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Tmod1P49813 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Tmod1P49813 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Tmod1P49813 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tmod1P49813 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Tmod1P49813 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tmod1P49813 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tmod1P49813 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Tmod1P49813 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Tmod1P49813 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Tmod1P49813 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tmod1P49813 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tmod1P49813 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Tmod1P49813 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Tmod1P49813 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tmod1P49813 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tmod1P49813 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Tmod1P49813 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Tmod1P49813 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tmod1P49813 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Tmod1P49813 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Tmod1P49813 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Tmod1P49813 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Tmod1P49813 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Tmod1P49813 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Tmod1P49813 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Tmod1P49813 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tmod1P49813 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Tmod1P49813 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Tmod1P49813 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Tmod1P49813 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tmod1P49813 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Tmod1P49813 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tmod1P49813 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tmod1P49813 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tmod1P49813 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Tmod1P49813 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tmod1P49813 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tmod1P49813 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tmod1P49813 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tmod1P49813 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms