Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
Pcdh11xF6ZNL5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Pcdh11xF6ZNL5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Pcdh11xF6ZNL5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Pcdh11xF6ZNL5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Pcdh11xF6ZNL5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Pcdh11xF6ZNL5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Pcdh11xF6ZNL5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Pcdh11xF6ZNL5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pcdh11xF6ZNL5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Pcdh11xF6ZNL5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Pcdh11xF6ZNL5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Pcdh11xF6ZNL5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Pcdh11xF6ZNL5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Pcdh11xF6ZNL5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Pcdh11xF6ZNL5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Pcdh11xF6ZNL5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pcdh11xF6ZNL5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Pcdh11xF6ZNL5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Pcdh11xF6ZNL5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Pcdh11xF6ZNL5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Pcdh11xF6ZNL5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pcdh11xF6ZNL5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Pcdh11xF6ZNL5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Pcdh11xF6ZNL5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pcdh11xF6ZNL5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Pcdh11xF6ZNL5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pcdh11xF6ZNL5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pcdh11xF6ZNL5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pcdh11xF6ZNL5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pcdh11xF6ZNL5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pcdh11xF6ZNL5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pcdh11xF6ZNL5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pcdh11xF6ZNL5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pcdh11xF6ZNL5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pcdh11xF6ZNL5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pcdh11xF6ZNL5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pcdh11xF6ZNL5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Pcdh11xF6ZNL5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Pcdh11xF6ZNL5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pcdh11xF6ZNL5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pcdh11xF6ZNL5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Pcdh11xF6ZNL5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pcdh11xF6ZNL5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Pcdh11xF6ZNL5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pcdh11xF6ZNL5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pcdh11xF6ZNL5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Pcdh11xF6ZNL5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pcdh11xF6ZNL5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pcdh11xF6ZNL5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Pcdh11xF6ZNL5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pcdh11xF6ZNL5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pcdh11xF6ZNL5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pcdh11xF6ZNL5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pcdh11xF6ZNL5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Pcdh11xF6ZNL5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Pcdh11xF6ZNL5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Pcdh11xF6ZNL5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Pcdh11xF6ZNL5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Pcdh11xF6ZNL5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Pcdh11xF6ZNL5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Pcdh11xF6ZNL5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Pcdh11xF6ZNL5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Pcdh11xF6ZNL5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Pcdh11xF6ZNL5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Pcdh11xF6ZNL5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Pcdh11xF6ZNL5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Pcdh11xF6ZNL5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
Pcdh11xF6ZNL5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Pcdh11xF6ZNL5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Pcdh11xF6ZNL5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pcdh11xF6ZNL5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pcdh11xF6ZNL5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pcdh11xF6ZNL5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Pcdh11xF6ZNL5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Pcdh11xF6ZNL5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pcdh11xF6ZNL5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Pcdh11xF6ZNL5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Pcdh11xF6ZNL5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Pcdh11xF6ZNL5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Pcdh11xF6ZNL5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pcdh11xF6ZNL5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Pcdh11xF6ZNL5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pcdh11xF6ZNL5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Pcdh11xF6ZNL5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Pcdh11xF6ZNL5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Pcdh11xF6ZNL5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Pcdh11xF6ZNL5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pcdh11xF6ZNL5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Pcdh11xF6ZNL5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Pcdh11xF6ZNL5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcdh11xF6ZNL5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pcdh11xF6ZNL5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Pcdh11xF6ZNL5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Pcdh11xF6ZNL5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms