Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
Hoxb13P70321 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Hoxb13P70321 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Hoxb13P70321 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Hoxb13P70321 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Hoxb13P70321 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Hoxb13P70321 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Hoxb13P70321 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Hoxb13P70321 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Hoxb13P70321 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Hoxb13P70321 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Hoxb13P70321 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Hoxb13P70321 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Hoxb13P70321 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Hoxb13P70321 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Hoxb13P70321 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Hoxb13P70321 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Hoxb13P70321 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Hoxb13P70321 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Hoxb13P70321 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Hoxb13P70321 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Hoxb13P70321 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Hoxb13P70321 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Hoxb13P70321 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Hoxb13P70321 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Hoxb13P70321 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Hoxb13P70321 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Hoxb13P70321 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Hoxb13P70321 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Hoxb13P70321 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Hoxb13P70321 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Hoxb13P70321 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Hoxb13P70321 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Hoxb13P70321 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Hoxb13P70321 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hoxb13P70321 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Hoxb13P70321 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Hoxb13P70321 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Hoxb13P70321 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Hoxb13P70321 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Hoxb13P70321 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Hoxb13P70321 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Hoxb13P70321 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Hoxb13P70321 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hoxb13P70321 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Hoxb13P70321 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hoxb13P70321 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Hoxb13P70321 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Hoxb13P70321 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hoxb13P70321 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hoxb13P70321 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hoxb13P70321 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Hoxb13P70321 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Hoxb13P70321 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Hoxb13P70321 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Hoxb13P70321 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Hoxb13P70321 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Hoxb13P70321 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Hoxb13P70321 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Hoxb13P70321 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Hoxb13P70321 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Hoxb13P70321 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Hoxb13P70321 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Hoxb13P70321 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Hoxb13P70321 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Hoxb13P70321 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Hoxb13P70321 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Hoxb13P70321 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Hoxb13P70321 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Hoxb13P70321 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Hoxb13P70321 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hoxb13P70321 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hoxb13P70321 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Hoxb13P70321 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Hoxb13P70321 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Hoxb13P70321 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Hoxb13P70321 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Hoxb13P70321 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Hoxb13P70321 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Hoxb13P70321 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Hoxb13P70321 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Hoxb13P70321 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Hoxb13P70321 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Hoxb13P70321 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Hoxb13P70321 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Hoxb13P70321 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Hoxb13P70321 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Hoxb13P70321 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Hoxb13P70321 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Hoxb13P70321 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Hoxb13P70321 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Hoxb13P70321 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Hoxb13P70321 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Hoxb13P70321 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Hoxb13P70321 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Hoxb13P70321 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Hoxb13P70321 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Hoxb13P70321 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Hoxb13P70321 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Hoxb13P70321 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms