RNA–Protein interactions for RNA: YML009C

MRPL39, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL39, Length 213 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL39	YML009C	PEX6	P33760	1030 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	MIA40	P36046	403 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	FZO1	P38297	855 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	MGE1	P38523	228 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YHR180W	P38868	163 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YFR054C	P43622	192 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	PRY1	P47032	299 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	TOS2	P50078	622 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	MON1	P53129	644 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	GET1	P53192	235 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YNR068C	P53754	272 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	IGO1	P53897	168 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YPL039W	Q03080	316 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	SNX41	Q04053	625 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	SPC24	Q04477	213 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	COX20	Q04935	205 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	CRR1	Q05790	422 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	ARO10	Q06408	635 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	HDA2	Q06629	674 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	ULA1	Q12059	462 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	MCP1	Q12106	302 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	MHF2	Q3E829	80 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	MET2	P08465	486 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	ERD2	P18414	219 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	UTR1	P21373	530 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	CMK2	P22517	447 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	SWH1	P35845	1188 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YMR262W	P38430	313 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	COG3	P40094	801 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	SNM1	P40993	198 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	NIT2	P47016	307 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YJR142W	P47173	342 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	MSY1	P48527	492 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	NUP57	P48837	541 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	DSL1	P53847	754 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YMR102C	Q03177	834 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	PLB2	Q03674	706 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	PEX12	Q04370	399 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	SPC2	Q04969	178 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	GPI11	Q06636	219 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	VPS36	Q06696	566 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	TSC13	Q99190	310 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	CTA1	P15202	515 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	MDH2	P22133	377 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	HIR2	P32480	875 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	SLC1	P33333	303 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	MAM33	P40513	266 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	HXT9	P40885	567 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	LYS5	P50113	272 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	SHE4	P51534	789 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YNR040W	P53736	256 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	HXT11	P54862	567 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	IRC19	Q07843	230 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	MRX4	Q12467	430 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	BLM10	P43583	2143 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	ITR2	P30606	609 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	SNC1	P31109	117 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	TFC1	P32367	649 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	MDL1	P33310	695 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	MDJ1	P35191	511 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	MRPL39	P36533	70 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	RIB1	P38066	345 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	CHK1	P38147	527 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YHR219W	P38900	624 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	RCY1	P39531	840 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	RBG1	P39729	369 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YIL166C	P40445	542 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MRPL39	YML009C	YFL066C	P43538	392 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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