RNA–Protein interactions for RNA: YLL047W

YLL047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLL047W, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL047WYLL047W YLR177WQ06251 628 aa3.45□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W SHS1Q07657 551 aa3.45□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W GAT3Q07928 141 aa3.45□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W RAX2Q12465 1220 aa3.45□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W ASP3-2P0CX77 362 aa3.44□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W ASP3-3P0CX78 362 aa3.44□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W ASP3-4P0CX79 362 aa3.44□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W ASP3-1P0CZ17 362 aa3.44□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W WSS1P38838 269 aa3.44□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W FSH2Q05015 223 aa3.44□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W ATP16Q12165 160 aa3.44□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W YDR061WQ12298 539 aa3.44□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W MSK1P32048 576 aa3.43□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W SHE1P38200 338 aa3.43□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W CTK3P46963 296 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W MPS2P53159 387 aa3.43□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W RNH201P53942 307 aa3.43□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W MIR1P23641 311 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W COS9P36034 407 aa3.42□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W YHR182WP38870 785 aa3.42□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W RCF1Q03713 159 aa3.42□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W YLH47Q06493 454 aa3.42□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W PEX27Q08580 376 aa3.42□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W FAA1P30624 700 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W DAD2P36162 133 aa3.41□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W HEM14P40012 539 aa3.41□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W YGR015CP53208 328 aa3.41□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W EOS1P53938 366 aa3.41□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W YOR338WQ99326 363 aa3.41□□□□□ -1.86
YLL047WYLL047W RPS19AP07280 144 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W YSW1P38280 609 aa3.4□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W EFM3P47163 339 aa3.4□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W YGR067CP53243 804 aa3.4□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W UBA3Q99344 299 aa3.4□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W DBR1P24309 405 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W MSP1P28737 362 aa3.39□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W RXT2P38255 430 aa3.39□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W ECM34P38728 170 aa3.39□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W AIM23P47015 356 aa3.39□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W APJ1P53940 528 aa3.39□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W SLT2Q00772 484 aa3.39□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W YDR115WQ04598 105 aa3.39□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W PUT4P15380 627 aa3.38□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W FAR1P21268 830 aa3.38□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W GRR1P24814 1151 aa3.38□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W RDS1P25611 832 aa3.38□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W WSC4P38739 605 aa3.38□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W YJR054WP47114 497 aa3.38□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W BIO3P50277 480 aa3.38□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W YNR068CP53754 272 aa3.38□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W SRO7Q12038 1033 aa3.38□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W FSH3Q99369 266 aa3.38□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W SCH9P11792 824 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W THR4P16120 514 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W EPT1P22140 391 aa3.37□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W SPS19P32573 292 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W YBR241CP38142 488 aa3.37□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W SNL1P40548 159 aa3.37□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W LST7P53237 242 aa3.37□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W SED5Q01590 340 aa3.37□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W GAS2Q06135 555 aa3.37□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W SFG1Q12507 346 aa3.37□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W NBL1Q3E7Y6 73 aa3.37□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W DET1Q99288 334 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W YOL085CQ99345 113 aa3.37□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W CCH1P50077 2039 aa3.36□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W PDC2P32896 925 aa3.36□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W EFM1P38732 585 aa3.36□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W YPT35P38815 214 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W YER184CP39961 794 aa3.36□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W COQ5P49017 307 aa3.36□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W RMI1Q02685 241 aa3.36□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W AIM33Q04516 312 aa3.36□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W ALE1Q08548 619 aa3.36□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W SLM3Q12093 417 aa3.36□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W FAB1P34756 2278 aa3.36□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W DAP2P18962 818 aa3.35□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W PMT2P31382 759 aa3.35□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W TPS2P31688 896 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W HMX1P32339 317 aa3.35□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W CYM1P32898 989 aa3.35□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W SMP1P38128 452 aa3.35□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W SLX1P38324 304 aa3.35□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W YHR122WP38829 231 aa3.35□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W YJR030CP47101 745 aa3.35□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W UTP6Q02354 440 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W RPN8Q08723 338 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
YLL047WYLL047W YOR376WQ08900 122 aa3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.1 ms