RNA–Protein interactions for RNA: YHR206W

SKN7, Transcript of Nuclear response regulator and transcription factor, yeast

Gene SKN7, Length 1,869 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKN7	YHR206W	PEX10	Q05568	337 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	BUR2	Q05949	395 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ATG9	Q12142	997 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	CBS2	P14905	389 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	MDM10	P18409	493 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	YKL162C	P36052	402 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	OPT1	P40897	799 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	PKP2	P53170	491 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	RSA1	Q08932	381 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	SNF8	Q12483	233 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	RPN13	O13563	156 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	RIP1	P08067	215 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	PCT1	P13259	424 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	STE4	P18851	423 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	YSP3	P25036	478 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	YMC1	P32331	307 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	VPH2	P32341	215 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	APL3	P38065	1025 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	VHC1	P38329	1120 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	HIS2	P38635	335 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	CYC2	P38909	366 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	UIP3	P39547	235 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	YIR016W	P40572	265 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	YGR168C	P53293	376 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	GOR1	P53839	350 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	YNL140C	P53910	189 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	RMI1	Q02685	241 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	MDM30	Q05930	598 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	DXO1	Q06349	442 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ARR3	Q06598	404 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	OSW1	Q08692	278 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	RAD50	P12753	1312 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	SCEI	P03882	235 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	PUT1	P09368	476 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	RPB8	P20436	146 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	RAD57	P25301	460 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	PPZ1	P26570	692 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	MSK1	P32048	576 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	NDC1	P32500	655 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	RGT1	P32862	1170 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	MCH2	P36032	473 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ECM8	P38246	354 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ELO1	P39540	310 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	COX15	P40086	486 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	PCI8	P40512	444 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ATG27	P46989	271 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	MDV1	P47025	714 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	FYV6	P53913	173 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	OST6	Q03723	332 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	UBX2	Q04228	584 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	NDE2	Q07500	545 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	YPL150W	Q12152	901 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	SIA1	Q12212	622 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	RGS2	Q99188	309 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	RHO2	P06781	192 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	GAC1	P28006	793 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ACH1	P32316	526 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	TCA17	P32613	152 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	IES6	P32617	166 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	RRN10	P38204	145 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ICS2	P38284	255 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	DER1	P38307	211 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	INM1	P38710	295 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	SSN2	P38931	1420 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ECM10	P39987	644 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	GAT2	P40209	560 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SKN7	YHR206W	ALG8	P40351	577 aa		3.12	□□□□□ -1.91

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