RNA–Protein interactions for RNA: YGR008C

STF2, Transcript of Protein involved in resistance to desiccation stress, yeast

Gene STF2, Length 255 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STF2	YGR008C	VTA1	Q06263	330 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	STP4	Q07351	490 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	MCH1	Q07376	486 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	COS7	Q07788	383 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	YPL229W	Q99395	206 aa		0.92	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	UBR1	P19812	1950 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	UNG1	P12887	359 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	PDX1	P16451	410 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	CLN1	P20437	546 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	MRPL4	P36517	319 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	RRN10	P38204	145 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	YHR035W	P38769	630 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	MNN1	P39106	762 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	YER189W	P40104	122 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	RGI2	P40188	164 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.91	□□□□□ -2.26	not detected
STF2	YGR008C	APS3	P47064	194 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	CCC1	P47818	322 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	ROG1	P53118	685 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	COS1	P53822	381 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	NHX1	Q04121	633 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	GTB1	Q04924	702 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	MSC3	Q05812	728 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	CTS2	Q06350	511 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	YLL007C	Q07799	665 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	GAT3	Q07928	141 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	CRT10	Q08226	957 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	YDL180W	Q12301	547 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	SET6	Q12529	373 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
STF2	YGR008C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	RPS23B	P0CX30	145 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	HNM1	P19807	563 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	NDI1	P32340	513 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	UTR5	P32630	166 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	YPT7	P32939	208 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	GPI18	P38211	433 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	KRE9	P39005	276 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	YER184C	P39961	794 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	YND1	P40009	630 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	NDE1	P40215	560 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	BUD8	P41698	603 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	PHO86	P46956	311 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	YPT11	P48559	417 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	YIP5	P53108	310 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	MET14	Q02196	202 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	BUR2	Q05949	395 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	SEI1	Q06058	285 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	BOP2	Q06150	570 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	YPR172W	Q06608	200 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	HNT3	Q08702	217 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	YOR378W	Q08902	515 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	ATG29	Q12092	213 aa		0.9	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	COX2	P00410	251 aa		0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	COS2	P0CX12	379 aa		0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	COS3	P0CX13	379 aa		0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	PEP5	P12868	1029 aa		0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	MDH2	P22133	377 aa		0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	DAL2	P25335	343 aa		0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	ACH1	P32316	526 aa		0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	ATP11	P32453	318 aa		0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	YME2	P32843	850 aa		0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.89	□□□□□ -2.27	not detected
STF2	YGR008C	TIP20	P33891	701 aa		0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	PEX5	P35056	612 aa		0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	RRN3	P36070	627 aa		0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	MAL33	P38157	468 aa		0.89	□□□□□ -2.27
STF2	YGR008C	PHO90	P39535	881 aa		0.89	□□□□□ -2.27

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