RNA–Protein interactions for RNA: YJL126W

NIT2, Transcript of Nit protein, yeast

Gene NIT2, Length 924 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NIT2	YJL126W	PTP1	P25044	335 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
NIT2	YJL126W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	LOT5	P34234	306 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	OAR1	P35731	278 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	YBR139W	P38109	508 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	MNL1	P38888	796 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	KRE29	P40026	464 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	IES5	P40060	125 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	YJL068C	P40363	299 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	TED1	P40533	473 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	YPS6	P40583	537 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	IRC5	P43610	853 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	STE24	P47154	453 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	TWF1	P53250	332 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	SUN4	P53616	420 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	YML053C	Q04978	212 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	SOG2	Q08817	791 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	LAG2	Q92325	660 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	SIR3	P06701	978 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	PDE2	P06776	526 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	HOP1	P20050	605 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	YCK1	P23291	538 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	ARE1	P25628	610 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	YPK3	P38070	525 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	OSH7	P38755	437 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	TAT2	P38967	592 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	LTP1	P40347	161 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	MET28	P40573	187 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	IBA57	P47158	497 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	YNR014W	P53719	212 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	MTQ1	P53944	314 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	REC102	Q02721	264 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	YMD8	Q03697	442 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	COX20	Q04935	205 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	ARO10	Q06408	635 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	BSC1	Q12140	328 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.72	□□□□□ -1.65
NIT2	YJL126W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	ENA1	P13587	1091 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	SNF5	P18480	905 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	HOG1	P32485	435 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	LYP1	P32487	611 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	DOA1	P36037	715 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	SBE22	P38814	852 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	CTF8	P38877	133 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	IPT1	P38954	527 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	IRC6	P43615	237 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	EFM3	P47163	339 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	HMS2	P47175	358 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	YGR168C	P53293	376 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	COG5	P53951	403 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	ARP10	Q04549	284 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	NAT4	Q04751	285 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	RNH202	Q05635	350 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	DCS1	Q06151	350 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	VPS36	Q06696	566 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	SYO1	Q07395	620 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	FMP45	Q07651	309 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	NTG2	Q08214	380 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	IRC13	Q08630	104 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	FDH1	Q08911	376 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	TRM10	Q12400	293 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	RPN13	O13563	156 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	SAM35	P14693	329 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	RPB5	P20434	215 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	SSH4	P32343	579 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	SRB5	P32585	307 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	YRO2	P38079	344 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NIT2	YJL126W	SEA4	P38164	1038 aa		4.7	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.3 ms