RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SYO1Q07395 620 aa3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data3.8□□□□□ -1.8not detected
SPC105YGL093W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W BAR1P12630 587 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W ERD1P16151 362 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W ERG8P24521 451 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W MXR2P25566 168 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W POL4P25615 582 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data3.79□□□□□ -1.8not detected
SPC105YGL093W PTR2P32901 601 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W PDX3P38075 228 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W FMP52P40008 231 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W IRC6P43615 237 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SEH1P53011 349 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YGL235WP53071 178 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W PLM2Q04383 521 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W TAD3Q9URQ3 322 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SNF4P12904 322 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W ECL1P48235 211 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W DBP6P53734 629 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W PFA5Q03289 374 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YDR249CQ03787 373 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W RNH202Q05635 350 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W BUR2Q05949 395 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W MCP1Q12106 302 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W PSF1Q12488 208 aa3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W DET1Q99288 334 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W DPM1P14020 267 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W ITR2P30606 609 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W TUL1P36096 758 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W ANS1P38832 159 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YAR028WP39548 234 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W PTI1P39927 425 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YER184CP39961 794 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YIL166CP40445 542 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W MAL11P53048 616 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YGL101WP53144 215 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YGR016WP53209 190 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W TPC1P53257 314 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W CGI121Q03705 181 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W GRE1Q08969 168 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W MOD5P07884 428 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W GPI12P23797 304 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W NUD1P32336 851 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YPT7P32939 208 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W GPX1P36014 167 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W NSG1P38837 291 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SOK1P40317 901 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YTA6P40328 754 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W POP1P41812 875 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W EMC2P47133 292 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W BAT2P47176 376 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W PDR16P53860 351 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W RNH1Q04740 348 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YPR127WQ06494 345 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W REH1Q06709 432 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YOR376WQ08900 122 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W YOR342CQ12182 319 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W SET6Q12529 373 aa3.78□□□□□ -1.8
SPC105YGL093W RPB10P22139 70 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W RER1P25560 188 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W EHD3P28817 500 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W SNC1P31109 117 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W SSE2P32590 693 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W TRS65P32893 560 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W MSN4P33749 630 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W LHS1P36016 881 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W MCM7P38132 845 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W MLH1P38920 769 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W PRE6P40303 254 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W IKS1P47042 667 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W DCP2P53550 970 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W MTQ1P53944 314 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W ABZ2Q03266 374 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W MLC2Q06580 163 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W HDA2Q06629 674 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W MMP1Q12372 583 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W YPR015CQ12531 247 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W CPR3P25719 182 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W PRP19P32523 503 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W SLC1P33333 303 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W SEA4P38164 1038 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W RRP4P38792 359 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W YJL193WP39542 402 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W COG3P40094 801 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data3.77□□□□□ -1.81not detected
SPC105YGL093W VPS73P53142 486 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W CUZ1P53899 274 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W SPO19Q03029 223 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W DFG5Q05031 458 aa3.77□□□□□ -1.81
SPC105YGL093W AVO1Q08236 1176 aa3.77□□□□□ -1.81
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