RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W TPC1P53257 314 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W SNF12P53628 566 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W SPO19Q03029 223 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YDR179W-AQ03983 463 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W NAT4Q04751 285 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YPR091CQ06833 770 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W GUP2Q08929 609 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W MHF1Q3E835 90 aa8.24□□□□□ -1.09
DDI1YER143W CNA1P23287 553 aa8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W TEF4P36008 412 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W FES1P38260 290 aa8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W UTP25P40498 721 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W ICE2P40499 491 aa8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W MSS2P40990 351 aa8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W JHD2P47156 728 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W TOS2P50078 622 aa8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W MAL11P53048 616 aa8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W MPC1P53157 130 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W RNH70P53331 553 aa8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W MEP3P53390 489 aa8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YDR541CQ03049 344 aa8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W TLG1Q03322 224 aa8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W ENT2Q05785 613 aa8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W VPS36Q06696 566 aa8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YOR365CQ08844 703 aa8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W TY1A-BLQ12266 440 aa8.23□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YOR062CP36025 268 aa8.22□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YBR138CP38277 524 aa8.22□□□□□ -1.09
DDI1YER143W ANS1P38832 159 aa8.22□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YEL068CP39977 110 aa8.22□□□□□ -1.09
DDI1YER143W AVT6P40074 448 aa8.22□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YJR098CP47139 656 aa8.22□□□□□ -1.09
DDI1YER143W HMS2P47175 358 aa8.22□□□□□ -1.09
DDI1YER143W NUP57P48837 541 aa8.22□□□□□ -1.09
DDI1YER143W SLD3P53135 668 aa8.22□□□□□ -1.09
DDI1YER143W TMA20P89886 181 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
DDI1YER143W ATG17Q06410 417 aa8.22□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YPR172WQ06608 200 aa8.22□□□□□ -1.09
DDI1YER143W GLE1Q12315 538 aa8.22□□□□□ -1.09
DDI1YER143W YOL163WP0CF20 169 aa8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W CMK1P27466 446 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W FAA1P30624 700 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W PRP21P32524 280 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W KAP122P32767 1081 aa8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W SRO77P38163 1010 aa8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YHR219WP38900 624 aa8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W ALP1P38971 573 aa8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W ISC1P40015 477 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YNL195CP40168 261 aa8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W ALB1P47019 175 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W TRM9P49957 279 aa8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W SIZ1Q04195 904 aa8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W DFG5Q05031 458 aa8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YLR345WQ06137 509 aa8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YDL211CQ12121 372 aa8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W PST2Q12335 198 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W ACC1Q00955 2233 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W IRA1P18963 3092 aa8.21□□□□□ -1.1
DDI1YER143W BAR1P12630 587 aa8.2□□□□□ -1.1
DDI1YER143W TFS1P14306 219 aa8.2□□□□□ -1.1
DDI1YER143W PRP19P32523 503 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
DDI1YER143W OCA5P38738 679 aa8.2□□□□□ -1.1
DDI1YER143W CTF8P38877 133 aa8.2□□□□□ -1.1
DDI1YER143W AST2P39945 430 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
DDI1YER143W RRG9P40156 214 aa8.2□□□□□ -1.1
DDI1YER143W SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
DDI1YER143W GRX5Q02784 150 aa8.2□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa8.2□□□□□ -1.1
DDI1YER143W MED11Q99278 115 aa8.2□□□□□ -1.1
DDI1YER143W FAS1P07149 2051 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W TAL1P15019 335 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W DAL82P21705 255 aa8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W RPL5P26321 297 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W MKK2P32491 506 aa8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W BET3P36149 193 aa8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W ECM34P38728 170 aa8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YHR210CP38893 341 aa8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W IPT1P38954 527 aa8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W MBP1P39678 833 aa8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W SOK1P40317 901 aa8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W SMK1P41808 388 aa8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YGR168CP53293 376 aa8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YPL068CQ02749 293 aa8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W INP1Q03694 420 aa8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W CRT10Q08226 957 aa8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W VCX1Q99385 411 aa8.19□□□□□ -1.1
DDI1YER143W CAR2P07991 424 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W SAC7P17121 654 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W GPI12P23797 304 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YCR100CP25606 316 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W ITR2P30606 609 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W TOD6P34219 525 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YKR015CP36111 568 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W VPS51P36116 164 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W YLF2P38746 405 aa8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
DDI1YER143W APE4P38821 490 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 62 ms