RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475912.1

PRKD3-208, Transcript of protein kinase D3, human

TSL 3

Gene PRKD3, Length 760 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKD3-208	ENST00000475912	KCND1	Q9NSA2	647 aa		7	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		7	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912		K7ESM1	405 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	PLAT	P00750	562 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	KNG1	P01042	644 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	NFATC3	Q12968	1075 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	SAMD9	Q5K651	1589 aa		6.99	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	PRX	Q9BXM0	1461 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	KLHL18	O94889	574 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	APP	P05067	770 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	ITGB3	P05106	788 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	GJA4	P35212	333 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	SQSTM1	Q13501	440 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	CPZ	Q66K79	652 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	UBXN4	Q92575	508 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF536	O15090	1300 aa		6.98	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	SCD	O00767	359 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	KCNQ2	O43526	872 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	PLCH2	O75038	1416 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	CHGB	P05060	677 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	EFEMP1	Q12805	493 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	SEC23A	Q15436	765 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	TM4SF20	Q53R12	229 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	6.97	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		6.97	□□□□□ -1.29
PRKD3-208	ENST00000475912		H0Y858	1186 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	PLD2	O14939	933 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	KCNA6	P17658	529 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	MC4R	P32245	332 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912		Q6ZUG5	572 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		6.96	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	KDM5C	P41229	1560 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	RERE	Q9P2R6	1566 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	ALK	Q9UM73	1620 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	LAMTOR5	O43504	91 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	PTGS1	P23219	599 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	AOAH	P28039	575 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	KRTAP10-2	P60368	255 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	AFAP1	Q8N556	730 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	PIF1	Q9H611	641 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	BTBD7	Q9P203	1132 aa		6.95	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	ABCA6	Q8N139	1617 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	PLA2R1	Q13018	1463 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	B4GALT4	O60513	344 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	MME	P08473	750 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	NFKB2	Q00653	900 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	SURF1	Q15526	300 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	SPATS1	Q496A3	300 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	TMEM177	Q53S58	311 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	INCENP	Q9NQS7	918 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	AGL	P35573	1532 aa		6.94	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	NPAT	Q14207	1427 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC12A8	A0AV02	714 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	ESYT3	A0FGR9	886 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	CSF2RB	P32927	897 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	HERVK_113	P62684	666 aa		6.93	□□□□□ -1.3
PRKD3-208	ENST00000475912	PPP2CB	P62714	309 aa		6.93	□□□□□ -1.3

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