RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

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Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NTRK3Q16288 839 aa6.63□□□□□ -1.35
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD276Q5ZPR3 534 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 STYK1Q6J9G0 422 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AQP7O14520 342 aa6.62□□□□□ -1.35
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NEK4P51957 841 aa6.62□□□□□ -1.35
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PALM2Q8IXS6 379 aa6.62□□□□□ -1.35
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KATNBL1Q9H079 304 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 VPS11Q9H270 941 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.62□□□□□ -1.35
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ALDH1L1O75891 902 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 COL6A2P12110 1019 aa6.61□□□□□ -1.35
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PFKPQ01813 784 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KCTD1Q719H9 257 aa6.61□□□□□ -1.35
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.61□□□□□ -1.35
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 E2F8A0AVK6 867 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SUV39H1O43463 412 aa6.6□□□□□ -1.35
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZEB2O60315 1214 aa6.6□□□□□ -1.35
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UBR7Q8N806 425 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TTC1Q99614 292 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KCNJ15Q99712 375 aa6.6□□□□□ -1.35
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TRAPPC13P1-201ENST00000435991 STRN3Q13033 797 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPR155Q7Z3F1 870 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IPPKQ9H8X2 491 aa6.58□□□□□ -1.36
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