RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	FLCN	Q8NFG4	579 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNER	Q8NFT8	737 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	TLE6	Q9H808	572 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	DGKI	O75912	1065 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPARA	Q07869	468 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCNC3	Q14003	757 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	LPIN1	Q14693	890 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRIM50	Q86XT4	487 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	IL31RA	Q8NI17	732 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPTC7	Q8NI37	304 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	POMK	Q9H5K3	350 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		10.15	□□□□□ -0.78
NIF3L1-206	ENST00000416651	ATRX	P46100	2492 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	GGPS1	O95749	300 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	TEC	P42680	631 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	NOV	P48745	357 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	DUSP6	Q16828	381 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	PANK1	Q8TE04	598 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	DCAF4	Q8WV16	495 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	TSPY2	A6NKD2	308 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIDE1	A8MVS5	230 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	LGALS2	P05162	132 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	ADAM17	P78536	824 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	MGAT3	Q09327	533 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	LAMC2	Q13753	1193 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	STXBP2	Q15833	593 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	ST3GAL2	Q16842	350 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM26D	Q5JW98	314 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRR7	Q8TB68	274 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	APPBP2	Q92624	585 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	P2RX5	Q93086	422 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPATA33	Q96N06	139 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	RMDN3	Q96TC7	470 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLVAP	Q9BX97	442 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651		H3BRB1	525 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	OPLAH	O14841	1288 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPFIA4	O75335	1185 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	NR3C2	P08235	984 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	PDHB	P11177	359 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	MTMR3	Q13615	1198 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	MCTP2	Q6DN12	878 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	NEK1	Q96PY6	1258 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	FSCN2	O14926	492 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	CD52	P31358	61 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLCN5	P51795	746 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF543	Q08ER8	600 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCNH2	Q12809	1159 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	VPS53	Q5VIR6	699 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	APBB2	Q92870	758 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	PXMP2	Q9NR77	195 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	COL4A3	Q01955	1670 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NIF3L1-206	ENST00000416651	SOBP	A7XYQ1	873 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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