RNA–Protein interactions for RNA: YGR009C

SEC9, Transcript of t-SNARE protein required for secretory vesicle-plasma membrane fusion, yeast

Gene SEC9, Length 1,956 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEC9	YGR009C	MRPL36	P36531	177 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	WSC4	P38739	605 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	COX15	P40086	486 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	GUF1	P46943	645 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	SFH5	P47008	294 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	CTH1	P47976	325 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	ARH1	P48360	493 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	RFX1	P48743	811 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	MSC1	Q03104	513 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	ALE1	Q08548	619 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	FCY22	Q12119	530 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	NBP2	Q12163	236 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	MMS22	Q06164	1454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	COX2	P00410	251 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	SEC12	P11655	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	HYM1	P32464	399 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	JEN1	P36035	616 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	YPK3	P38070	525 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	PCA1	P38360	1216 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	GPB2	P39717	880 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	HXT13	P39924	564 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	AAD14	P42884	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	YJL118W	P47022	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	HXT17	P53631	564 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	NRK1	P53915	240 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	YLR460C	P54007	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	HXT15	P54854	567 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	CAB1	Q04430	367 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	THI22	Q06490	572 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	PER33	Q12144	273 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	SVS1	Q12254	260 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	SAG1	P20840	650 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	SYN8	P31377	255 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	SPT14	P32363	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	UGX2	P32772	223 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	SHP1	P34223	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	KAE1	P36132	386 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	BNA4	P38169	460 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	YBL029W	P38201	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	PFF1	P38244	976 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	SNG1	P46950	547 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	ASG7	P46993	209 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	TAH11	P47112	604 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	SOL1	P50278	321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	IMA1	P53051	589 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	CAB5	Q03941	241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	YHM2	Q04013	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	PEX30	Q06169	523 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	YPR078C	Q06813	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	YET3	Q07451	203 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	DFG16	Q99234	619 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	FSH3	Q99369	266 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	PSK1	P31374	1356 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	BNR1	P40450	1375 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	PEP1	P32319	1579 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	PUT1	P09368	476 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	MRP13	P12686	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	ARG1	P22768	420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	NDC1	P32500	655 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	NAT2	P37293	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	FLR1	P38124	548 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	SLM4	P38247	162 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	SOL3	P38858	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	OXA1	P39952	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	YHC3	P47040	408 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	YNL260C	P53846	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	HRD1	Q08109	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	SRL2	Q12020	392 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	POM33	Q12164	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	RKM5	Q12367	367 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	VCX1	Q99385	411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	TAF2	P23255	1407 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	IQG1	Q12280	1495 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	CDC21	P06785	304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SEC9	YGR009C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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