RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C HEM2P05373 342 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RHO2P06781 192 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CDC21P06785 304 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C FUM1P08417 488 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C BAR1P12630 587 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RSR1P13856 272 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C NMT1P14743 455 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C HSC82P15108 705 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MET8P15807 274 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ART10P18634 518 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SCL1P21243 252 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CDC10P25342 322 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C BUD14P27637 709 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RPC19P28000 142 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SPR1P32603 445 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TFB1P32776 642 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MRE11P32829 692 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C PTH2P34222 208 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YKL100CP34248 587 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C NUP120P35729 1037 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SOL2P37262 315 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YHR045WP38775 560 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C UBA4P38820 440 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C UTP9P38882 575 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SEC31P38968 1273 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C NPT1P39683 429 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C UTP18P40362 594 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C COA1P40452 197 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C IMA5P40884 581 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C VMA13P41807 478 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YRB1P41920 201 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TAF6P53040 516 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C EFM5P53200 248 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YGR079WP53249 370 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SHY1P53266 389 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C IBD2P53892 351 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SWS2P53937 143 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SLM2P53955 656 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C LSM3P57743 89 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RMI1Q02685 241 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C BCH1Q05029 724 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RIF2Q06208 395 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C VAM6Q07468 1049 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C AIM6Q07716 390 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ENT4Q07872 247 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C PLB3Q08108 686 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RPN8Q08723 338 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C PPT2Q12036 173 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C PST1Q12355 444 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YPL247CQ12523 523 aa2.13□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C FAB1P34756 2278 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C COS2P0CX12 379 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C COS3P0CX13 379 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RED1P14291 827 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C GUK1P15454 187 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C PPH21P23594 369 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CLB1P24868 471 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SDH3P33421 198 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MUM2P38236 366 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C GDT1P38301 280 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C HSM3P38348 480 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YHR127WP38833 243 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ELO1P39540 310 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YAL037WP39728 267 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C GIM4P40005 111 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YER034WP40022 185 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C EMP65P40085 556 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YPS6P40583 537 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SSU1P41930 458 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C ZIM17P42844 174 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C COS4P43542 379 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YFR020WP43600 232 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CIS3P47001 227 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YJR149WP47177 404 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YJR154WP47181 346 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MRM2P53123 320 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MPS2P53159 387 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YGR015CP53208 328 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C GTR2P53290 341 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C NOP19P53317 196 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C BOR1P53838 576 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YNL260CP53846 198 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SUB1P54000 292 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MRS2Q01926 470 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YML131WQ03102 365 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C TRM82Q03774 444 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YOL019WQ08157 551 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YDR056CQ12025 205 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YBR255C-AQ3E776 120 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C YPT6Q99260 215 aa2.12□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C MDM35O60200 86 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CAR1P00812 333 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C STE3P06783 470 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C SPT3P06844 337 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CUP1-1P0CX80 61 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C CUP1-2P0CX81 61 aa2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C PDA1P16387 420 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
GCN4YEL009C EXO70P19658 623 aa2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.5 ms