RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CALM1	P0DP23	149 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CALM2	P0DP24	149 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CALM3	P0DP25	149 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	AR	P10275	920 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	ACTR2	P61160	394 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	P2RX5	Q93086	422 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	NFASC	O94856	1347 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	MAFG	O15525	162 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	NCK2	O43639	380 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CCNE2	O96020	404 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	SCG2	P13521	617 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	FUT2	Q10981	343 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	PAK2	Q13177	524 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAM15	Q13444	863 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	IER5	Q5VY09	327 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	TMTC2	Q8N394	836 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	AZI2	Q9H6S1	392 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CLEC1B	Q9P126	229 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	HCST	Q9UBK5	93 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	CD207	Q9UJ71	328 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		13.65	□□□□□ -0.22
TTLL3-233	ENST00000602338	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	MGEA5	O60502	916 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	GLP2R	O95838	553 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFV1	P49821	464 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM260	Q9NX78	707 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	USP34	Q70CQ2	3546 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338		M0QZ92	97 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	STXBP3	O00186	592 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ATG7	O95352	703 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	STAT5B	P51692	787 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	NAPA	P54920	295 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	CEP55	Q53EZ4	464 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF135	Q8IUD6	432 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	POF1B	Q8WVV4	589 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	MEIS1	O00470	390 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAMTS3	O15072	1205 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	EYA4	O95677	639 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	SREBF1	P36956	1147 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	NRIP1	P48552	1158 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ADCY7	P51828	1080 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT76	Q01546	638 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	NHLH1	Q02575	133 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	EFHB	Q8N7U6	833 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM86B1	E9PN63	330 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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