RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ENC1O14682 589 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 TIMM44O43615 452 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 TUBP50607 506 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 MTMR3Q13615 1198 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ITGA7Q13683 1181 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 NR1I3Q14994 352 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC15A3Q8IY34 581 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP8B4Q8TF62 1192 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 CENPTQ96BT3 561 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF711Q9Y462 761 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 DYTNA2CJ06 578 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 RGL2O15211 777 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 NVLO15381 856 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP9BO43861 1147 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 AKR1B10O60218 316 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ITGA2BP08514 1039 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 NPR1P16066 1061 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 COPS2P61201 443 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 PTPN21Q16825 1174 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 SNX27Q96L92 541 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF180Q9UJW8 692 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 PLAAQ9Y263 795 aa8.41□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ZMYM6O95789 1325 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A1B0GTH6 734 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC162PA2VCL2 907 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 SRGNP10124 158 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 TCP1P17987 556 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 NCALDP61601 193 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 DMPKQ09013 629 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 RCN2Q14257 317 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM50Q86XT4 487 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 STK32AQ8WU08 396 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 JDP2Q8WYK2 163 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 OCEL1Q9H607 264 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 SYNCQ9H7C4 482 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ABCC12Q96J65 1359 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 MGEA5O60502 916 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 TACC1O75410 805 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 LDHAP00338 332 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 PFKFB1P16118 471 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 ADORA1P30542 326 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 USP11P51784 963 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 KCNJ2P63252 427 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 TCIRG1Q13488 830 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 GSTA3Q16772 222 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 SYNE4Q8N205 404 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.067e-7■■■□□ 16.6
EFTUD2-218ENST00000590367 POLD4Q9HCU8 107 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 PRELID1Q9Y255 219 aa8.4□□□□□ -1.06
EFTUD2-218ENST00000590367 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SRGAP2O75044 1071 aa8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 TOMM70O94826 608 aa8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 ASLP04424 464 aa8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 MECOMQ03112 1051 aa8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SUSD4Q5VX71 490 aa8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 OLFML2BQ68BL8 750 aa8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 LINC00301Q8NCQ3 95 aa8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 IFT43Q96FT9 208 aa8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.4□□□□□ -1.07
EFTUD2-218ENST00000590367 KCNMB3Q9NPA1 279 aa8.4□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms