RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 PRDX5P30044 214 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 PPP2R1AP30153 589 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 CASP7P55210 303 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 ERVK-21P61565 698 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 CTBSQ01459 385 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 LMNB2Q03252 620 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 DMWDQ09019 674 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 PTPROQ16827 1216 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 SPRED3Q2MJR0 410 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 FBXL19Q6PCT2 694 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 DEFB128Q7Z7B8 93 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 RELL1Q8IUW5 271 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 ABRAQ8N0Z2 381 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 SHCBP1Q8NEM2 672 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNG4Q8TDN1 519 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 SCLYQ96I15 445 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRC3Q9BY71 257 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 WNT8AQ9H1J5 351 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 RASSF4Q9H2L5 321 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 CLDND1Q9NY35 253 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 BTBD7Q9P203 1132 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 CNPY2Q9Y2B0 182 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 AKAP2Q9Y2D5 859 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 KIF16BQ96L93 1317 aa4.97□□□□□ -1.61
ECHDC1-211ENST00000460558 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 MBTPS2O43462 519 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 NCK2O43639 380 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 PPFIA3O75145 1194 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 FCER1AP12319 257 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 SDHBP21912 280 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 KCNJ6P48051 423 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 FOXO4P98177 505 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP11AP98196 1134 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 CCDC30Q5VVM6 783 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 GIMAP6Q6P9H5 292 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 LMBR1LQ6UX01 489 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 SYT9Q86SS6 491 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 ASIC4Q96FT7 647 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 SPACA7Q96KW9 195 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 CRBNQ96SW2 442 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 FEZ1Q99689 392 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 ADAM19Q9H013 955 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 SEMA4AQ9H3S1 761 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 MROH8Q9H579 483 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 GINM1Q9NU53 330 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM184BQ9ULE4 1060 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 SOX13Q9UN79 622 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 TNKSO95271 1327 aa4.96□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 DMDP11532 3685 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 LCHNA4D1U4 455 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 MYADML2A6NDP7 307 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 PAGE1O75459 146 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 BAIAP3O94812 1187 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 B3GALT4O96024 378 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 LMNAP02545 664 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 RFC2P35250 354 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 TMPOP42166 694 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 USP14P54578 494 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 SERINC3Q13530 473 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 CLUL1Q15846 466 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 TCEAL5Q5H9L2 206 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 METTL24Q5JXM2 366 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 VN1R5Q7Z5H4 357 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 RPAINQ86UA6 219 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 SLITRK4Q8IW52 837 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 TRIM42Q8IWZ5 723 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 BSNDQ8WZ55 320 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 TTC9Q92623 222 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 VWCEQ96DN2 955 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 C12orf42Q96LP6 360 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 RIPOR3Q96MK2 946 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms