RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404548.5

HDAC11-205, Transcript of histone deacetylase 11, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HDAC11, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11-205ENST00000404548 TRIOO75962 3097 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC11-205ENST00000404548 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 PRR33A8MZF0 331 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 MEIS1O00470 390 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 ZBTB43O43298 467 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 CD52P31358 61 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 STAT5BP51692 787 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 ADCY7P51828 1080 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 IGBP1P78318 339 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 RTN1Q16799 776 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 ANO3Q9BYT9 981 aa22.14■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 STXBP3O00186 592 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 GRM6O15303 877 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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HDAC11-205ENST00000404548 CLDND1Q9NY35 253 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 PADI3Q9ULW8 664 aa22.13■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 POTEB3A0JP26 581 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 STAG3L1P0CL83 205 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 ARP10275 920 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 LTBRP36941 435 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 ZP2Q05996 745 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 KRT32Q14532 448 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 POTEBQ6S5H4 581 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 HYAL1Q12794 435 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 PAK2Q13177 524 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 COL1A2P08123 1366 aa22.11■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 SMCO2A6NFE2 343 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 HBP1O60381 514 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 SCG2P13521 617 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 MCTP2Q6DN12 878 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
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HDAC11-205ENST00000404548 ESYT2A0FGR8 921 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 CCNE2O96020 404 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 KRT76Q01546 638 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 CAMK1Q14012 370 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 PGBD1Q96JS3 809 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 DCXO43602 365 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 CYP3A4P08684 503 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 ODR4Q5SWX8 454 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 TMX1Q9H3N1 280 aa22.08■■□□□ 1.13
HDAC11-205ENST00000404548 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 KLRC1P26715 233 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 RASEFQ8IZ41 740 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 NID2Q14112 1375 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 FAM86B1E9PN63 330 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 BACH1O14867 736 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 ITGB1P05556 798 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 CDC27P30260 824 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 ZNF76P36508 570 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 ADAM15Q13444 863 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HDAC11-205ENST00000404548 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.06■■□□□ 1.12
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