RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa33.08■■■□□ 2.89
ECHS1-201ENST00000368547 PNMA5Q96PV4 448 aa33.08■■■□□ 2.89
ECHS1-201ENST00000368547 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
ECHS1-201ENST00000368547 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
ECHS1-201ENST00000368547 ERAP1Q9NZ08 941 aa33.08■■■□□ 2.89
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1024Q9UPX6 916 aa33.08■■■□□ 2.89
ECHS1-201ENST00000368547 F2P00734 622 aa33.07■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 ATP4AP20648 1035 aa33.07■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 GRB10Q13322 594 aa33.07■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 GSE1Q14687 1217 aa33.07■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 HYIQ5T013 277 aa33.07■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 CKAP2LQ8IYA6 745 aa33.07■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 FSIP1Q8NA03 581 aa33.07■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 KAT2BQ92831 832 aa33.07■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 PANK2Q9BZ23 570 aa33.07■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 SLC26A4O43511 780 aa33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 ACLYP53396 1101 aa33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 PRKCEQ02156 737 aa33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 C4orf19Q8IY42 314 aa33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 NT5C3AQ9H0P0 336 aa33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC39Q9UFE4 941 aa33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 A0A087X0B3 334 aa33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 KBTBD13C9JR72 458 aa33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 DNM1LO00429 736 aa33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 PFKFB1P16118 471 aa33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 MUTP22033 750 aa33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 SLC26A2P50443 739 aa33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 PDILTQ8N807 584 aa33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa33.06■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa33.05■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF445P59923 1031 aa33.05■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 KCNH3Q9ULD8 1083 aa33.05■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 A0A087WWV3 80 aa33.04■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 MOXD2PA6NHM9 499 aa33.04■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 LYPLA2O95372 231 aa33.04■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 PLCG1P19174 1290 aa33.04■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 CHMP4BP1P59074 171 aa33.04■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 FAM160A1Q05DH4 1040 aa33.04■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 PLCB4Q15147 1175 aa33.04■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM119Q4V9L6 283 aa33.04■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 RNPEPQ9H4A4 650 aa33.04■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 HPSEQ9Y251 543 aa33.04■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB39O15060 712 aa33.03■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 NDUFA8P51970 172 aa33.03■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 PSMC6P62333 389 aa33.03■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA0753Q2KHM9 967 aa33.03■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 ENGASEQ8NFI3 743 aa33.03■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 PIGOQ8TEQ8 1089 aa33.03■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 KATNAL1Q9BW62 490 aa33.03■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 DACT1Q9NYF0 836 aa33.03■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa33.03■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 STBD1O95210 358 aa33.02■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 OATP04181 439 aa33.02■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 PSEN2P49810 448 aa33.02■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 MFSD10Q14728 455 aa33.02■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 RRAGBQ5VZM2 374 aa33.02■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 KCNK18Q7Z418 384 aa33.02■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 NACC1Q96RE7 527 aa33.02■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM150BA6NC51 233 aa33.02■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 HAS3O00219 553 aa33.02■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 NR1I2O75469 434 aa33.02■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 YWHABP31946 246 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 XKR3Q5GH77 459 aa33.02■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 ATP8B4Q8TF62 1192 aa33.02■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 FAM167AQ96KS9 214 aa33.02■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 PHF24Q9UPV7 400 aa33.02■■■□□ 2.88
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 ANO5Q75V66 913 aa33.01■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC15Q8TF66 581 aa33.01■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP33.01■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP33.01■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 TRPC6Q9Y210 931 aa33.01■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa33■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PQY0 241 aa33■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 E9PMD0 336 aa33■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 CABYRO75952 493 aa33■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 GLT1D1Q96MS3 346 aa33■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 NRBP2Q9NSY0 501 aa33■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 DNM3Q9UQ16 869 aa33■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 ARID2Q68CP9 1835 aa32.99■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 STAT6P42226 847 aa32.99■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 SYKP43405 635 aa32.99■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP32.99■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP32.99■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 KCTD17Q8N5Z5 321 aa32.99■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa32.99■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 VTI1AQ96AJ9 217 aa32.99■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 DHX58Q96C10 678 aa32.99■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 DNAH12Q6ZR08 3092 aa32.99■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 NAALADL2Q58DX5 795 aa32.99■■■□□ 2.87
ECHS1-201ENST00000368547 PLA2G4FQ68DD2 849 aa32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms