RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	YNR061C	P53747	219 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YPL113C	Q02961	396 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	MSC1	Q03104	513 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RCF1	Q03713	159 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	GSH2	Q08220	491 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RBD2	Q12270	262 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RPN13	O13563	156 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	TFS1	P14306	219 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	SAM35	P14693	329 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	BNA4	P38169	460 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	AIM2	P39721	246 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RRG9	P40156	214 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	ALR2	P43553	858 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YGR079W	P53249	370 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RSM24	Q03976	319 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RNH1	Q04740	348 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	XYL2	Q07993	356 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	DCI1	Q08558	271 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	TFB4	Q12004	338 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	PNS1	Q12412	539 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	TEC1	P18412	486 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	CTF8	P38877	133 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	RCY1	P39531	840 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YTA6	P40328	754 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	PAC11	P40960	533 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	STB1	P42845	420 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YPR084W	Q06821	456 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	PFA4	Q12006	378 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YPL066W	Q12194	479 aa		7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	7.79	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	7.78	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	SFC1	P33303	322 aa		7.78	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	SBE22	P38814	852 aa		7.78	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	7.78	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	PUS9	Q12069	462 aa		7.78	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	YLR111W	Q12528	110 aa		7.78	□□□□□ -1.16
GGA2	YHR108W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	YHR112C	P38716	378 aa		7.77	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	YCK3	P39962	524 aa		7.77	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	NTA1	P40354	457 aa		7.77	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	MET28	P40573	187 aa		7.77	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SSY5	P47002	699 aa		7.77	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	HMS2	P47175	358 aa		7.77	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	YSA1	Q01976	231 aa		7.77	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	GRX3	Q03835	250 aa		7.77	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	URC2	Q04411	772 aa		7.77	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	GIT1	P25346	518 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	ARE1	P25628	610 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SSH4	P32343	579 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	NTH1	P32356	751 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	TUL1	P36096	758 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	PEX18	P38855	283 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	NEO1	P40527	1151 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	YJL049W	P47048	450 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	MAK3	Q03503	176 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	BOP2	Q06150	570 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	YLR446W	Q06204	433 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SIA1	Q12212	622 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SPT23	P35210	1082 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	BAP2	P38084	609 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SEA4	P38164	1038 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SNM1	P40993	198 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	RHO4	Q00246	291 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	RNH202	Q05635	350 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SKS1	Q12505	502 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SIR3	P06701	978 aa		7.75	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	RED1	P14291	827 aa		7.75	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SEC2	P17065	759 aa		7.75	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.75	□□□□□ -1.17	not detected
GGA2	YHR108W	OAC1	P32332	324 aa		7.75	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	HIR2	P32480	875 aa		7.75	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	SRL3	P36167	246 aa		7.75	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	GPX2	P38143	162 aa		7.75	□□□□□ -1.17
GGA2	YHR108W	PLB1	P39105	664 aa		7.75	□□□□□ -1.17

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