RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CYK3	YDL117W	COX4	P04037	155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ERG11	P10614	530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CBS2	P14905	389 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CST26	P38226	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	IST2	P38250	946 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YBR184W	P38299	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YBR285W	P38354	144 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	EFM1	P38732	585 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	NMA111	P53920	997 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	AIM36	Q03798	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	MDM30	Q05930	598 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CSC1	Q06538	782 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	HRT3	Q12347	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	GRX6	Q12438	231 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	MRX4	Q12467	430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ECM3	Q99252	613 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CDC7	P06243	507 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SWI5	P08153	709 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CBS1	P14066	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PHO91	P27514	894 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	COQ2	P32378	372 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	RGT1	P32862	1170 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
CYK3	YDL117W	MRPL4	P36517	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	AIM46	P38885	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	UBP5	P39944	805 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PIC2	P40035	300 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SAD1	P43589	448 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	HXT11	P54862	567 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SMA2	Q04658	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PUN1	Q06991	263 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YCK1	P23291	538 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CSM1	P25651	190 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	MRPL9	P31334	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SPC34	P36131	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	TVP38	P36164	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	WSS1	P38838	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ATF1	P40353	525 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	MNN5	P46982	586 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	IRC18	P47056	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	COG7	P53195	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YAT1	P80235	687 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	MRP51	Q02950	344 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	CAC2	Q04199	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	GAL83	Q04739	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YPR1	Q12458	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	MSF1	P08425	469 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ARG8	P18544	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YUR1	P26725	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	RRN10	P38204	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	FAD1	P38913	306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	GDS1	P41913	522 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	MRK1	P50873	501 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	STP1	Q00947	519 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	TVP18	Q04767	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ROY1	Q04847	553 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SPO75	Q07798	868 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SCP1	Q08873	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ERD2	P18414	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	SEC59	P20048	519 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	POF1	P25576	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ARE1	P25628	610 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PRE4	P30657	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	ERG3	P32353	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	MKK2	P32491	506 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YPT7	P32939	208 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	TRM2	P33753	639 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	EXO5	P38289	585 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	FET3	P38993	636 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	LCB2	P40970	561 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YGL159W	P53110	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	FMN1	Q03778	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CYK3	YDL117W	YAP6	Q03935	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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