RNA–Protein interactions for RNA: YBL039C

URA7, Transcript of Major CTP synthase isozyme (see also URA8), yeast

Gene URA7, Length 1,740 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
URA7	YBL039C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	UBP8	P50102	471 aa		5.1	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	BUD32	P53323	261 aa		5.1	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	URH1	Q04179	340 aa		5.1	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	YLR040C	Q07988	224 aa		5.1	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	AIM39	Q08223	395 aa		5.1	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	PUS9	Q12069	462 aa		5.1	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	RGS2	Q99188	309 aa		5.1	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	SUC2	P00724	532 aa		5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	PCL5	P38794	229 aa		5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	FET3	P38993	636 aa		5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	TRS85	P46944	698 aa		5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	FMP33	P46998	180 aa		5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	ECL1	P48235	211 aa		5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	ASI1	P54074	624 aa		5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	RSN1	Q03516	953 aa		5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	YDR387C	Q04162	555 aa		5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	CTS2	Q06350	511 aa		5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	YOL075C	Q08234	1294 aa		5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	BSC6	Q08280	497 aa		5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	YOS9	Q99220	542 aa		5.09	□□□□□ -1.59
URA7	YBL039C	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		5.09	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		5.09	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		5.09	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	KSS1	P14681	368 aa		5.09	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	LAG1	P38703	411 aa		5.09	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	YAL037W	P39728	267 aa		5.09	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	EXO1	P39875	702 aa		5.09	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	PMT5	P52867	743 aa		5.09	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	SNZ1	Q03148	297 aa		5.09	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	MCH4	Q08268	501 aa		5.09	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	YLL056C	Q12177	298 aa		5.09	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	YPR1	Q12458	312 aa		5.09	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	OPI3	P05375	206 aa		5.08	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	GPI12	P23797	304 aa		5.08	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	OCT1	P35999	772 aa		5.08	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	YKL071W	P36086	256 aa		5.08	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	SLX1	P38324	304 aa		5.08	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	SUL1	P38359	859 aa		5.08	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	YRB2	P40517	327 aa		5.08	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	YIL060W	P40519	144 aa		5.08	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.08	□□□□□ -1.6	not detected
URA7	YBL039C	AIM33	Q04516	312 aa		5.08	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	COX20	Q04935	205 aa		5.08	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	COQ11	Q05892	277 aa		5.08	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	ATG34	Q12292	412 aa		5.08	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	IMA3	P0CW40	589 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	IMA4	P0CW41	589 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	BAR1	P12630	587 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	MAK32	P23060	363 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	CSM1	P25651	190 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	CWP1	P28319	239 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	SRB4	P32569	687 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	TOD6	P34219	525 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	ERV46	P39727	415 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	ORC5	P50874	479 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	YGR117C	P53270	476 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	MPS1	P54199	764 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	SPP2	Q02521	185 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	YPL068C	Q02749	293 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	MMT1	Q03218	510 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	YLR283W	Q05867	314 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	BUR2	Q05949	395 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	IMA2	Q08295	589 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	YPR022C	Q12139	1133 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	ATG31	Q12421	196 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	TY2B-C	P25384	1770 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		5.07	□□□□□ -1.6
URA7	YBL039C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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