RNA–Protein interactions for RNA: YAL059W

ECM1, Transcript of Pre-ribosomal factor involved in 60S ribosomal protein subunit export, yeast

Gene ECM1, Length 639 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM1	YAL059W	PTC6	P25646	442 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	MSS51	P32335	436 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	QDR3	P38227	689 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	TSC10	P38342	320 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	EFM2	P38347	419 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	SMF2	P38778	549 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	FET3	P38993	636 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	PAC11	P40960	533 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	UBP16	Q02863	499 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	MRP51	Q02950	344 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	MSC1	Q03104	513 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YML053C	Q04978	212 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	NSE1	Q07913	336 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RMD5	Q12508	421 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	ZRC1	P20107	442 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	AMD2	P22580	549 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	GPI12	P23797	304 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	CIN8	P27895	1000 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	SIN4	P32259	974 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	PTR2	P32901	601 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	MRPL10	P36520	322 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RRN10	P38204	145 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	DBP8	P38719	431 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RTT107	P38850	1070 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	HXT9	P40885	567 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	FMP33	P46998	180 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	STE24	P47154	453 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	HXT11	P54862	567 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	SPP2	Q02521	185 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	SHR3	Q02774	210 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	PIG1	Q06216	648 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YPR1	Q12458	312 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	UBA3	Q99344	299 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	SCEI	P03882	235 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	SPT10	P35208	640 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YHR122W	P38829	231 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YHR177W	P38867	453 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	PRM9	P39551	298 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	PHM8	P40025	321 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	GLG2	P47011	380 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	ATP23	P53722	227 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	MRPL50	P53724	139 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	SLG1	P54867	378 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RTT103	Q05543	409 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	MDM30	Q05930	598 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	PAM18	Q07914	168 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RAX1	Q08760	435 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RUP1	Q12242	671 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RAD9	P14737	1309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YAK1	P14680	807 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	ATP10	P18496	279 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	INM1	P38710	295 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	GAT2	P40209	560 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	LAS21	P40367	830 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
ECM1	YAL059W	MRX5	P47007	382 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	KAP114	P53067	1004 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	COG2	P53271	262 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
ECM1	YAL059W	RSM23	Q01163	450 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	BUR2	Q05949	395 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	ORM2	Q06144	216 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	BSP1	Q06604	576 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	GRS2	Q06817	618 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	SOR2	Q07786	357 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	LCB4	Q12246	624 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	FRE7	Q12333	620 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RGS2	Q99188	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ECM1	YAL059W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65

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