RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 PYGMP11217 842 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 EFEMP1Q12805 493 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 CFAP100Q494V2 611 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 GGNQ86UU5 652 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 AHI1Q8N157 1196 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 CBLCQ9ULV8 474 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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TRDN-204ENST00000542443 GNAT1P11488 350 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 THBS2P35442 1172 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 STAT5AP42229 794 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 SLC6A11P48066 632 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 DNM2P50570 870 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 NEK4P51957 841 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 ST5P78524 1137 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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TRDN-204ENST00000542443 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 TMEM177Q53S58 311 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 EMC4Q5J8M3 183 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.97□□□□□ -1.29
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TRDN-204ENST00000542443 KYQ8NBH2 561 aa6.97□□□□□ -1.29
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TRDN-204ENST00000542443 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.97□□□□□ -1.29
TRDN-204ENST00000542443 CBX4O00257 560 aa6.96□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 COL6A2P12110 1019 aa6.96□□□□□ -1.3
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TRDN-204ENST00000542443 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 PTPROQ16827 1216 aa6.96□□□□□ -1.3
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TRDN-204ENST00000542443 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.96□□□□□ -1.3
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TRDN-204ENST00000542443 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.96□□□□□ -1.3
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TRDN-204ENST00000542443 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.95□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 M0R2C6 588 aa6.95□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 TRAF5O00463 557 aa6.95□□□□□ -1.3
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TRDN-204ENST00000542443 AMY2BP19961 511 aa6.95□□□□□ -1.3
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TRDN-204ENST00000542443 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.95□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.95□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 KRIT1O00522 736 aa6.94□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 ITGA1P56199 1179 aa6.94□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 AMPD3Q01432 767 aa6.94□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 CHRNA2Q15822 529 aa6.94□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 ZNF827Q17R98 1081 aa6.94□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 STEAP3Q658P3 488 aa6.94□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.94□□□□□ -1.3
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TRDN-204ENST00000542443 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
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TRDN-204ENST00000542443 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.94□□□□□ -1.3
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TRDN-204ENST00000542443 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.94□□□□□ -1.3
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TRDN-204ENST00000542443 CHST14Q8NCH0 376 aa6.93□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.93□□□□□ -1.3
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TRDN-204ENST00000542443 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.93□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 DSEQ9UL01 958 aa6.93□□□□□ -1.3
TRDN-204ENST00000542443 EEA1Q15075 1411 aa6.93□□□□□ -1.3
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