RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 CAND2O75155 1236 aa21.57■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 TDP2O95551 362 aa21.57■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 CXCL10P02778 98 aa21.57■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 MARK3P27448 753 aa21.57■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 KRT76Q01546 638 aa21.57■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 PLCB4Q15147 1175 aa21.57■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 INF2Q27J81 1249 aa21.57■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.57■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.57■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.57■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 RPAINQ86UA6 219 aa21.57■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.56■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.56■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 PPFIA1Q13136 1202 aa21.56■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 GRIK4Q16099 956 aa21.56■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.56■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.56■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa21.56■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 NBNO60934 754 aa21.55■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 PSMD10O75832 226 aa21.55■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 MMP1P03956 469 aa21.55■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 INSRRP14616 1297 aa21.55■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 KRT2P35908 639 aa21.55■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 MBTPS1Q14703 1052 aa21.55■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 FAM160B1Q5W0V3 765 aa21.55■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 SWSAP1Q6NVH7 229 aa21.55■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.55■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 NEK8Q86SG6 692 aa21.55■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.55■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.55■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 POTEB3A0JP26 581 aa21.54■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 ATP4AP20648 1035 aa21.54■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 THPOP40225 353 aa21.54■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 NR5A1Q13285 461 aa21.54■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 FAM26DQ5JW98 314 aa21.54■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 KRT40Q6A162 431 aa21.54■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 POTEBQ6S5H4 581 aa21.54■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.54■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.54■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 ZNF302Q9NR11 478 aa21.54■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 SCN5AQ14524 2016 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 BTBD18B2RXH4 712 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 BACH1O14867 736 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 ST18O60284 1047 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 PSAPP07602 524 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 RSPH10BP0C881 870 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 ACTN1P12814 892 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 LETM2Q2VYF4 491 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 TEKT3Q9BXF9 490 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 BACH2Q9BYV9 841 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.53■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 WDR64B1ANS9 1081 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 SLC37A4O43826 429 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 HBP1O60381 514 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 GAS7O60861 476 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 TRIM29Q14134 588 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 PDXDC2PQ6P474 469 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 DEFB123Q8N688 67 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 ATP8B4Q8TF62 1192 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 GJA10Q969M2 543 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 FAM20AQ96MK3 541 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 DISC1Q9NRI5 854 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 TRPC6Q9Y210 931 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.52■■□□□ 1.04
NISCH-209ENST00000485765 FAM205CA6NFA0 338 aa21.51■■□□□ 1.03
NISCH-209ENST00000485765 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.51■■□□□ 1.03
NISCH-209ENST00000485765 BAIAP3O94812 1187 aa21.51■■□□□ 1.03
NISCH-209ENST00000485765 SFNP31947 248 aa21.51■■□□□ 1.03
NISCH-209ENST00000485765 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.51■■□□□ 1.03
NISCH-209ENST00000485765 Q7L0L9 218 aa21.51■■□□□ 1.03
NISCH-209ENST00000485765 RDM1Q8NG50 284 aa21.51■■□□□ 1.03
NISCH-209ENST00000485765 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.51■■□□□ 1.03
NISCH-209ENST00000485765 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.51■■□□□ 1.03
NISCH-209ENST00000485765 TET1Q8NFU7 2136 aa21.5■■□□□ 1.03
NISCH-209ENST00000485765 TBX3O15119 743 aa21.5■■□□□ 1.03
NISCH-209ENST00000485765 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NISCH-209ENST00000485765 JAK3P52333 1124 aa21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms