RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAPPC3-202ENST00000373162 C6orf50Q9HD87 102 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-202ENST00000373162 REV3LO60673 3130 aa20.51■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-202ENST00000373162 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.5■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-202ENST00000373162 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-202ENST00000373162 LINC01553A4QN01 128 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC3-202ENST00000373162 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP11P51784 963 aa20.42■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-202ENST00000373162 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC3-202ENST00000373162 TOP1MTQ969P6 601 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC3-202ENST00000373162 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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