RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	ARR1	Q06596	294 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	MSH5	Q12175	901 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	IES3	Q12345	250 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	MHF1	Q3E835	90 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TPK3	P05986	398 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	ERS1	P17261	260 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	MRPL6	P32904	214 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	GOS1	P38736	223 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	IRC5	P43610	853 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	BIR1	P47134	954 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	GPI8	P49018	411 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	NBP35	P52920	328 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	COS12	P53053	380 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	AQR1	P53943	586 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	SWF1	Q04629	336 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	SWA2	Q06677	668 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	SGO1	Q08490	590 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	RIB3	Q99258	208 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	MED11	Q99278	115 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	UBR1	P19812	1950 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YPR096C	O13587	100 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	MET17	P06106	444 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YSR3	P23501	404 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	RER1	P25560	188 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	MEI5	P32489	222 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	EMC3	P36039	253 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	ARA1	P38115	344 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	ECM8	P38246	354 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	MTG2	P38860	518 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	CCT6	P39079	546 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	GDH3	P39708	457 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YEL020C	P39994	560 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	MUP1	P50276	574 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	SLD3	P53135	668 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	NPY1	P53164	384 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	HXT15	P54854	567 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	SED5	Q01590	340 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TLG1	Q03322	224 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	MPD2	Q99316	277 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	PET127	P32606	800 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	NPL6	P32832	435 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	NUF2	P33895	451 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	MUM2	P38236	366 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	FES1	P38260	290 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	GGC1	P38988	300 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	APQ12	P40532	138 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	AZF1	P41696	914 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	PMT4	P46971	762 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TY4A-J	P47023	414 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	BIO3	P50277	480 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	SDT1	P53078	280 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YNL181W	P53878	407 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	DAL4	Q04895	635 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YLR036C	Q07986	203 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	OPI10	Q08202	246 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	RRT8	Q08219	342 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	VPS68	Q12016	184 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	HAL9	Q12180	1030 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	HER1	Q12276	1246 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	CBS2	P14905	389 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	BET2	P20133	325 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TY2A-C	P25383	438 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	SSO1	P32867	290 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	APT2	P36973	181 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YLF2	P38746	405 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	KRE29	P40026	464 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	MAD2	P40958	196 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YJL043W	P47053	257 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	SGF73	P53165	657 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	DAM1	P53267	343 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	OAZ1	Q02803	292 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	YPL107W	Q02873	248 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MIA40	YKL195W	ARP10	Q04549	284 aa		6.22	□□□□□ -1.41

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