RNA–Protein interactions for RNA: YJL198W

PHO90, Transcript of Low-affinity phosphate transporter, yeast

Gene PHO90, Length 2,646 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PHO90	YJL198W	ZRT3	P34240	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	PZF1	P39933	429 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	UBP9	P39967	754 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SHR5	P41912	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MRH4	P53166	561 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	TIM13	P53299	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YNL033W	P53964	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YNL019C	P53975	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	GPM3	Q12326	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SCEI	P03882	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	UGA1	P17649	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YUR1	P26725	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MDL1	P33310	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YBL028C	P38202	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MSR1	P38714	643 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	PSD1	P39006	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SKP2	P42843	763 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YFL012W	P43580	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	AIM24	P47127	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	VPS9	P54787	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YAT1	P80235	687 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	APA2	P22108	325 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	STE50	P25344	346 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	BEM1	P29366	551 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	LDS1	P31379	325 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	FUN26	P31381	517 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MTC7	P32633	139 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	SRY1	P36007	326 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	KAE1	P36132	386 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MRPL7	P36519	292 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	ECM8	P38246	354 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
PHO90	YJL198W	PLB1	P39105	664 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	YIR035C	P40579	254 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	LCB2	P40970	561 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	IMA1	P53051	589 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RMT2	Q03305	412 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	TCO89	Q08921	799 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	MLH3	Q12083	715 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	RPN6	Q12377	434 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	DCN1	Q12395	269 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PHO90	YJL198W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	AMD2	P22580	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	HCM1	P25364	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	ATP11	P32453	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	ASH1	P34233	588 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	CPR5	P35176	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	MAC1	P35192	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	GCS1	P35197	352 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YEL057C	P39983	233 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	KHA1	P40309	873 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	CLD1	P53264	445 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	ARP10	Q04549	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	MUM3	Q08750	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	MAS2	P11914	482 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	ARN2	P38724	620 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	VPS62	P53285	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	RSM27	P53305	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	PLM2	Q04383	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	AIM33	Q04516	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	BUR2	Q05949	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	GMC2	Q06201	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	SWA2	Q06677	668 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	TPO1	Q07824	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	TGL5	Q12043	749 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	MAS1	P10507	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PHO90	YJL198W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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