RNA–Protein interactions for RNA: YHL008C

YHL008C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YHL008C, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL008CYHL008C SRY1P36007 326 aa8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C FRE2P36033 711 aa8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C CAF4P36130 643 aa8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C OCA5P38738 679 aa8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C MNN1P39106 762 aa8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C PGD1P40356 397 aa8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C YJL218WP40892 196 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C SEH1P53011 349 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C RRN9P53437 365 aa8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C YNR062CP53748 327 aa8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C KAP120Q02932 1032 aa8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C YMD8Q03697 442 aa8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C NHX1Q04121 633 aa8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C PLM2Q04383 521 aa8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C YLR413WQ06689 675 aa8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C THI73Q07904 523 aa8.35□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C CKS1P20486 150 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C DAL81P21657 970 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C MRPL7P36519 292 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C TAT1P38085 619 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C YBL028CP38202 106 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C SOH1P38633 127 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C FET3P38993 636 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C HPA3P39979 161 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C GTT3P39996 337 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C YIL166CP40445 542 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C AAD10P47182 288 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C SNN1P48232 102 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C NAM8Q00539 523 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C GAS2Q06135 555 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C YDL121CQ07541 149 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C YOL131WQ08270 108 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C PUS9Q12069 462 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C GLO4Q12320 285 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C RKM5Q12367 367 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C MDM12Q92328 271 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C PMD1P32634 1753 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C UBR2Q07963 1872 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C CHS1P08004 1131 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data8.34□□□□□ -1.07not detected
YHL008CYHL008C IFM1P25038 676 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C PUP1P25043 261 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C DOA4P32571 926 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C ORC2P32833 620 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C YBR238CP38330 731 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C ERP2P39704 215 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C YJL132WP47014 750 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C COX16P47081 118 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C TAM41P53230 385 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C MKC7P53379 596 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C YNL181WP53878 407 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C SIW14P53965 281 aa8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C CWC21Q03375 135 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YHL008CYHL008C MRPL44P19956 98 aa8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C YCR090CP25654 182 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C YUR1P26725 428 aa8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C BEM1P29366 551 aa8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C LHP1P33399 275 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C SNU114P36048 1008 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C HSL7P38274 827 aa8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C DOT6P40059 670 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C SWM2P40342 146 aa8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C SEC28P40509 296 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C RET2P43621 546 aa8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C NBP35P52920 328 aa8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C STR3P53101 465 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C MRPL22P53881 309 aa8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C OCA2P53949 197 aa8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C CYK3Q07533 885 aa8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C RRP40Q08285 240 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C FUM1P08417 488 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C MET2P08465 486 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C SRM1P21827 482 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C IDP1P21954 428 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C TUL1P36096 758 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C APL3P38065 1025 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C YMR262WP38430 313 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C SLX8P40072 274 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data8.32□□□□□ -1.08not detected
YHL008CYHL008C SET4P42948 560 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C ATG18P43601 500 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C YJR154WP47181 346 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C GTR2P53290 341 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C PUS6P53294 404 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C GAS3Q03655 524 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C DPB4Q04603 196 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C RPN5Q12250 445 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C WTM1Q12363 437 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C YPL247CQ12523 523 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C AFI1Q99222 893 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C MAS2P11914 482 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C SGF29P25554 259 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C UTR2P32623 467 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C RIB1P38066 345 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C PRS3P38689 320 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C NDT80P38830 627 aa8.32□□□□□ -1.08
YHL008CYHL008C PTC2P39966 464 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 91.2 ms