RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639221.1

SLC35A3-216, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC35A3, Length 1,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-216ENST00000639221 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa25.44■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 KRT2P35908 639 aa25.44■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 LRIT3Q3SXY7 679 aa25.44■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa25.44■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 LTBP2Q14767 1821 aa25.44■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 ADAMTS3O15072 1205 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 CSF2RAP15509 400 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 RFC2P35250 354 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 CCL23P55773 120 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 ACTR2P61160 394 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 PTK7Q13308 1070 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 IL23AQ9NPF7 189 aa25.43■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 EMSYQ7Z589 1322 aa25.42■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 PARNO95453 639 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 PFKMP08237 780 aa25.42■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 KRT76Q01546 638 aa25.42■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 FAM160B1Q5W0V3 765 aa25.42■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa25.42■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.42■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 TRIM50Q86XT4 487 aa25.42■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 ATP6V0A1Q93050 837 aa25.42■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 PCDH10Q9P2E7 1040 aa25.42■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 KIF3AQ9Y496 699 aa25.42■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa25.41■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 NRCAMQ92823 1304 aa25.41■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 M0R2N6 131 aa25.41■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 BACH1O14867 736 aa25.41■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 JAK2O60674 1132 aa25.41■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 SLC26A2P50443 739 aa25.41■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 SHHQ15465 462 aa25.41■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 STAT5BP51692 787 aa25.4■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 NPY5RQ15761 445 aa25.4■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 INF2Q27J81 1249 aa25.4■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 Q4G0T1 1027 aa25.4■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa25.4■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 NEK8Q86SG6 692 aa25.4■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 RIT2Q99578 217 aa25.4■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 RNPEPQ9H4A4 650 aa25.4■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa25.39■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 GAS7O60861 476 aa25.39■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 LGR5O75473 907 aa25.39■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 FGBP02675 491 aa25.39■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 CYP3A7P24462 503 aa25.39■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 PPFIA1Q13136 1202 aa25.39■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 LETM2Q2VYF4 491 aa25.39■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.39■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 C8orf76Q96K31 380 aa25.39■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 BACH2Q9BYV9 841 aa25.39■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 SAMM50Q9Y512 469 aa25.39■■□□□ 1.66
SLC35A3-216ENST00000639221 UMODL1Q5DID0 1318 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 RRN3P2A6NIE6 340 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 MARCH6O60337 910 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 ATG7O95352 703 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 MMP1P03956 469 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 PSAPP07602 524 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 IQCF3P0C7M6 154 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 ACTN1P12814 892 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 SELPP16109 830 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 MARK3P27448 753 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 C9orf50Q5SZB4 431 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 TEKT3Q9BXF9 490 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 WNT8AQ9H1J5 351 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 SETD4Q9NVD3 440 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 TRPC6Q9Y210 931 aa25.38■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 EPHB4P54760 987 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 RBL2Q08999 1139 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 KRT40Q6A162 431 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 LRRC8DQ7L1W4 858 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 SERINC5Q86VE9 423 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 SCLYQ96I15 445 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 ZNF302Q9NR11 478 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 TELO2Q9Y4R8 837 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.36■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 WDR64B1ANS9 1081 aa25.36■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 MSH4O15457 936 aa25.36■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 DTNBO60941 627 aa25.36■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 CAND2O75155 1236 aa25.36■■□□□ 1.65
SLC35A3-216ENST00000639221 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms