RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559974.5

RABGGTA-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,963 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-212ENST00000559974 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 LDHDQ86WU2 507 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 POTEFA5A3E0 1075 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 CYP3A4P08684 503 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 SLC12A3P55017 1021 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 FAM83BQ5T0W9 1011 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 NCAPH2Q6IBW4 605 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 POTEGQ6S5H5 508 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 POTEEQ6S8J3 1075 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 CATSPER3Q86XQ3 398 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 SLC35F6Q8N357 371 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 FRMD3A2A2Y4 597 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 CTAGE9A4FU28 777 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 MSH4O15457 936 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 TBC1D12O60347 775 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 ABL1P00519 1130 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 RPA1P27694 616 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 TUBB2AQ13885 445 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 TUBB2BQ9BVA1 445 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF408Q9H9D4 720 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 PHF20L1A8MW92 1017 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 KIF20AO95235 890 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 KRT18P05783 430 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 KRT83P78385 493 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 CDK17Q00537 523 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 CCDC170Q8IYT3 715 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 HAUS4Q9H6D7 363 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 OGFRQ9NZT2 677 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 TBC1D7Q9P0N9 293 aa16.02■□□□□ 0.16
RABGGTA-212ENST00000559974 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 INPP5BP32019 993 aa16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF76P36508 570 aa16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 HERVK_113P62684 666 aa16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CBX1P83916 185 aa16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 ARSHQ5FYA8 562 aa16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF662Q6ZS27 426 aa16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CHURC1Q8WUH1 139 aa16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CEP63Q96MT8 703 aa16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 VCPKMTQ9H867 229 aa16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CDC23Q9UJX2 597 aa16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 VAV3Q9UKW4 847 aa16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 DNM3Q9UQ16 869 aa16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa16.02■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 SH2D4AQ9H788 454 aa16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 PLA2G6O60733 806 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CLCN6P51797 869 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 PSMC6P62333 389 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 MAP3K10Q02779 954 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CCDC174Q6PII3 467 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CYP2W1Q8TAV3 490 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 SCFD1Q8WVM8 642 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 GOLGA1Q92805 767 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 USP2O75604 605 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 GNA14O95837 355 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CFBP00751 764 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CAP2P40123 477 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CCDC40Q4G0X9 1142 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 TEX35Q5T0J7 233 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CHADLQ6NUI6 762 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 CEP112Q8N8E3 955 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 RABGGTAQ92696 567 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 KCTD10Q9H3F6 313 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 EMILIN3Q9NT22 766 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF446Q9NWS9 450 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 GUCA1BQ9UMX6 200 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 PLAGL2Q9UPG8 496 aa16■□□□□ 0.15
RABGGTA-212ENST00000559974 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.6 ms