RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM260	Q9NX78	707 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	SAMM50	Q9Y512	469 aa		12.88	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246		M0QZ92	97 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	MARCH6	O60337	910 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	PFKFB2	O60825	505 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	BAIAP3	O94812	1187 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP3A4	P08684	503 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	USP11	P51784	963 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	AK2	P54819	239 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	PPFIA1	Q13136	1202 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	NTRK3	Q16288	839 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	PKN1	Q16512	942 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	BLID	Q8IZY5	108 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	TRPC6	Q9Y210	931 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	STK36	Q9NRP7	1315 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	KAT6A	Q92794	2004 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	MEIS1	O00470	390 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP9A	O75110	1047 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	PPFIA3	O75145	1194 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	STAT5B	P51692	787 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT76	Q01546	638 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	SCRN1	Q12765	414 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	SEMA3F	Q13275	785 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	PRR16	Q569H4	304 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC9A7	Q96T83	725 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	ST18	O60284	1047 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	PSAP	P07602	524 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	RSPH10B	P0C881	870 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	CKB	P12277	381 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	MARK3	P27448	753 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	EPHB4	P54760	987 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	ACTR2	P61160	394 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	IKBKE	Q14164	716 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	TIFA	Q96CG3	184 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	GAS7	O60861	476 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	AR	P10275	920 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	SERINC5	Q86VE9	423 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF302	Q9NR11	478 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	SETD4	Q9NVD3	440 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	KIF3A	Q9Y496	699 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TTLL3-231	ENST00000496246	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJB2	P25686	324 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	SFN	P31947	248 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	CIITA	P33076	1130 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT2	P35908	639 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	IGBP1	P78318	339 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	RBL2	Q08999	1139 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	GRIK4	Q16099	956 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	IER5	Q5VY09	327 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM50	Q86XT4	487 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	TBCK	Q8TEA7	893 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	SEPT8	Q92599	483 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	GTF3C6	Q969F1	213 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM167A	Q96KS9	214 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TTLL3-231	ENST00000496246	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.4 ms