RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426925.5

SH3BP5-206, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

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Gene SH3BP5, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-206ENST00000426925 PGM2Q96G03 612 aa18.35■□□□□ 0.53
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SH3BP5-206ENST00000426925 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-206ENST00000426925 PCDHA6Q9UN73 950 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-206ENST00000426925 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa18.35■□□□□ 0.53
SH3BP5-206ENST00000426925 FAM205AQ6ZU69 1335 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-206ENST00000426925 KLHL33A6NCF5 533 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-206ENST00000426925 CLTAP09496 248 aa18.34■□□□□ 0.53
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SH3BP5-206ENST00000426925 SLC39A2Q9NP94 309 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-206ENST00000426925 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-206ENST00000426925 CCDC169A6NNP5 214 aa18.34■□□□□ 0.53
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SH3BP5-206ENST00000426925 GNA14O95837 355 aa18.34■□□□□ 0.53
SH3BP5-206ENST00000426925 NUDT17P0C025 328 aa18.34■□□□□ 0.53
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SH3BP5-206ENST00000426925 MMP13P45452 471 aa18.34■□□□□ 0.53
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SH3BP5-206ENST00000426925 TXNRD1Q16881 649 aa18.34■□□□□ 0.53
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SH3BP5-206ENST00000426925 TMC4Q7Z404 712 aa18.34■□□□□ 0.53
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SH3BP5-206ENST00000426925 RASGEF1CQ8N431 466 aa18.34■□□□□ 0.53
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SH3BP5-206ENST00000426925 RAB17Q9H0T7 212 aa18.34■□□□□ 0.53
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SH3BP5-206ENST00000426925 ACSBG1Q96GR2 724 aa18.33■□□□□ 0.52
SH3BP5-206ENST00000426925 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SH3BP5-206ENST00000426925 NEUROG2Q9H2A3 272 aa18.33■□□□□ 0.52
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SH3BP5-206ENST00000426925 ADCY2Q08462 1091 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-206ENST00000426925 AP1ARQ63HQ0 302 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-206ENST00000426925 SYNE4Q8N205 404 aa18.32■□□□□ 0.52
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SH3BP5-206ENST00000426925 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-206ENST00000426925 KCNMB3Q9NPA1 279 aa18.32■□□□□ 0.52
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SH3BP5-206ENST00000426925 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-206ENST00000426925 ANKRD33BA6NCL7 494 aa18.32■□□□□ 0.52
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SH3BP5-206ENST00000426925 INF2Q27J81 1249 aa18.32■□□□□ 0.52
SH3BP5-206ENST00000426925 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
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SH3BP5-206ENST00000426925 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
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SH3BP5-206ENST00000426925 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-206ENST00000426925 STARD3NLO95772 234 aa18.31■□□□□ 0.52
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SH3BP5-206ENST00000426925 LRRC57Q8N9N7 239 aa18.31■□□□□ 0.52
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SH3BP5-206ENST00000426925 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
SH3BP5-206ENST00000426925 MYH1P12882 1939 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-206ENST00000426925 DCDC2CA8MYV0 355 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-206ENST00000426925 AGTP01019 485 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-206ENST00000426925 C6orf118Q5T5N4 469 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-206ENST00000426925 AGAP11Q8TF27 550 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-206ENST00000426925 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-206ENST00000426925 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP5-206ENST00000426925 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
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