RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 RASGRF1Q13972 1273 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 NRBF2Q96F24 287 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF804BA4D1E1 1349 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 GAS7O60861 476 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 IFNA8P32881 189 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 TMED2Q15363 201 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 TMTC4Q5T4D3 741 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 FMO2Q99518 471 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 YIPF3Q9GZM5 350 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 PLAAQ9Y263 795 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRM-202ENST00000400053 AGLP35573 1532 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 STAM2O75886 525 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SKIP12755 728 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TCP10Q12799 353 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 NSMFQ6X4W1 530 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 USP32Q8NFA0 1604 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 WDR91A4D1P6 747 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 MYO1FO00160 1098 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 LRRN2O75325 713 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 APOEP02649 317 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 XPAP23025 273 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ATP2B4P23634 1241 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SPDL1Q96EA4 605 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 PAGE5Q96GU1 130 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 FAM81BQ96LP2 452 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 RWDD2AQ9UIY3 292 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ESYT3A0FGR9 886 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGEF37A1IGU5 675 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 DLATP10515 647 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SCYL2Q6P3W7 929 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC138Q96M89 665 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 MAGEF1Q9HAY2 307 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.882e-6■■□□□ 12.9
PTPRM-202ENST00000400053 TTI1O43156 1089 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 WDR24Q96S15 920 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 GDAQ9Y2T3 454 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TRPA1O75762 1119 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 PTPREP23469 700 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 CCNE1P24864 410 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 NFKBIAP25963 317 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 IQCB1Q15051 598 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SAAL1Q96ER3 474 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM11Q96F44 468 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TSC22D3Q99576 134 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 CUEDC2Q9H467 287 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 LAD1O00515 517 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SAT1P21673 171 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 PDE6CP51160 858 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 DEUP1Q05D60 604 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 FAM167BQ9BTA0 163 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SCINQ9Y6U3 715 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 CDHR2Q9BYE9 1310 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TECPR2O15040 1411 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 INHBAP08476 426 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 FOXO4P98177 505 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 MYO1EQ12965 1108 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 HLFQ16534 295 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms