RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 KCNH7Q9NS40 1196 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 OTOFQ9HC10 1997 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 FRMPD4Q14CM0 1322 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 LGALS16A8MUM7 142 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 ZBTB39O15060 712 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 BCRP11274 1271 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 CASP14P31944 242 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 KCNJ6P48051 423 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 TMEM132BQ14DG7 1078 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 PGM5Q15124 567 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 B3GNT9Q6UX72 402 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 FAM114A1Q8IWE2 563 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 MB21D1Q8N884 522 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 RUSC1Q9BVN2 902 aa19.88■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 PES1O00541 588 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP19.87■□□□□ 0.776e-13■□□□□ 9.5
ACTB-201ENST00000331789 GYPCP04921 128 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 TNNT1P13805 278 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 NIPA1Q7RTP0 329 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 ZNF507Q8TCN5 953 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 RMDN3Q96TC7 470 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 RIT2Q99578 217 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 REEP2Q9BRK0 252 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 POLD4Q9HCU8 107 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 PTPRFP10586 1907 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 B4DLN1 442 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.773e-14■■□□□ 11.8
ACTB-201ENST00000331789 EPHA7Q15375 998 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 SH3D19Q5HYK7 790 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 JADE2Q9NQC1 790 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 PXMP2Q9NR77 195 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.773e-23■□□□□ 10.8
ACTB-201ENST00000331789 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 DHX15O43143 795 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 OAZ1P54368 228 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 LRRC63Q05C16 580 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 NELFCDQ8IXH7 590 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 PANX2Q96RD6 677 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 PDCD2LQ9BRP1 358 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 BCAS3Q9H6U6 928 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 RSPH10B2B2RC85 870 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 STX10O60499 249 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 MFAP3LO75121 409 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 RSPH10BP0C881 870 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 ARHGEF16Q5VV41 709 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 RINT1Q6NUQ1 792 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 NYAP1Q6ZVC0 841 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 SCFD1Q8WVM8 642 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 TSG101Q99816 390 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 ARHGAP6O43182 974 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 PTPN14Q15678 1187 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 MIIPQ5JXC2 388 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 LRRC55Q6ZSA7 311 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 SFR1Q86XK3 245 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 KCTD17Q8N5Z5 321 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 BANK1Q8NDB2 785 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 HOXC10Q9NYD6 342 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 CSADQ9Y600 493 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 DNM2P50570 870 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 CASP5P51878 434 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 MTMR1Q13613 665 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 PLS1Q14651 629 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 ZCWPW2Q504Y3 356 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 TREML2Q5T2D2 321 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 MIER3Q7Z3K6 550 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 TPM2P07951 284 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 TERF1P54274 439 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 DPY19L2Q6NUT2 758 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 MOB2Q70IA6 237 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 NACC1Q96RE7 527 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 ELP3Q9H9T3 547 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PQC6 194 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-201ENST00000331789 ATP2A1O14983 1001 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-201ENST00000331789 TPM1P09493 284 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-201ENST00000331789 MUTP22033 750 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-201ENST00000331789 C1orf186Q6ZWK4 172 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-201ENST00000331789 CNGA4Q8IV77 575 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-201ENST00000331789 LXNQ9BS40 222 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-201ENST00000331789 TEX13BQ9BXU2 312 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-201ENST00000331789 KCTD10Q9H3F6 313 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-201ENST00000331789 SFI1A8K8P3 1242 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-201ENST00000331789 TRAF5O00463 557 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-201ENST00000331789 PEX10O60683 326 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-201ENST00000331789 ATP9AO75110 1047 aa19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms