RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR104W	YKR104W	SMA1	Q02651	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	ECM18	Q04623	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	PDR8	Q06149	701 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	VAM3	Q12241	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR104W	YKR104W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	CTM1	P38818	585 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	YIL152W	P40455	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	VPS20	Q04272	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	TEN1	Q07921	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	GSH2	Q08220	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	VPS63	O13549	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	NUP133	P36161	1157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	YAT2	P40017	923 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	PHM8	P40025	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	VHS2	P40463	436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	YFR020W	P43600	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	EFM3	P47163	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	UBP8	P50102	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	OCA2	P53949	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	ATG9	Q12142	997 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	PCT1	P13259	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	GAC1	P28006	793 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	HIR2	P32480	875 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	CIN4	P39110	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	CDC1	P40986	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	YHC3	P47040	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	VPS25	P47142	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	YIP5	P53108	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	LSB1	P53281	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	YPR003C	P53394	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	GRS2	Q06817	618 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	MCH4	Q08268	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	PMR1	P13586	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	PET123	P17558	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	PET18	P25362	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	RDS1	P25611	832 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	CAB3	P36076	571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	MRPL37	P36532	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	MSG5	P38590	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	DBP8	P38719	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	TOM22	P49334	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	MPS2	P53159	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	TAP42	Q04372	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	COQ9	Q05779	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	PIG1	Q06216	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	SRN2	Q99176	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	BEM1	P29366	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	ECM25	P32525	599 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	COT1	P32798	439 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	RGT1	P32862	1170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	PEX18	P38855	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	YER130C	P39959	443 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	YGL108C	P53139	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	CSI1	Q04368	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	SWF1	Q04629	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	CUR1	Q06469	252 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	YRM1	Q12340	786 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	RAV1	P47104	1357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	RHO2	P06781	192 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	PUT2	P07275	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	MER1	P16523	270 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	YCR043C	P25361	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	RAD51	P25454	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	HMX1	P32339	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	MNL1	P38888	796 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	END3	P39013	349 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	YGL114W	P53134	725 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YKR104W	YKR104W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 75.4 ms